Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 RPN1YHR027C 2982 nt3.4□□□□□ -1.86
TFC8Q12308 snR70snR70 164 nt3.4□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 EMC5YIL027C 426 nt3.4□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 NIP1YMR309C 2439 nt3.39□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 SCD5YOR329C 2619 nt3.38□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt3.38□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 YML054C-AYML054C-A 159 nt3.37□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 SSN2YDR443C 4263 nt3.36□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 YEF3YLR249W 3135 nt3.35□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 RAX2YLR084C 3663 nt3.35□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 DRS2YAL026C 4068 nt3.35□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 ROM2YLR371W 4071 nt3.35□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 TUS1YLR425W 3924 nt3.34□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 PET127YOR017W 2403 nt3.34□□□□□ -1.87
TFC8Q12308 PAN2YGL094C 3348 nt3.33□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 TOF1YNL273W 3717 nt3.33□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 IRE1YHR079C 3348 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 POL2YNL262W 6669 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 TAO3YIL129C 7131 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 SGS1YMR190C 4344 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 snR190snR190 190 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 PMR1YGL167C 2853 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 MET18YIL128W 3099 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 TCB2YNL087W 3537 nt3.32□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 TRL1YJL087C 2484 nt3.31□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 CHS1YNL192W 3396 nt3.31□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.3□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 GYP5YPL249C 2685 nt3.3□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 SYH1YPL105C 2550 nt3.3□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 STT4YLR305C 5703 nt3.3□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 MSB2YGR014W 3921 nt3.28□□□□□ -1.88
TFC8Q12308 ESL1YIL151C 3357 nt3.27□□□□□ -1.89
TFC8Q12308 AMS1YGL156W 3252 nt3.27□□□□□ -1.89
TFC8Q12308 BPT1YLL015W 4680 nt3.23□□□□□ -1.89
TFC8Q12308 ILS1YBL076C 3219 nt3.23□□□□□ -1.89
TFC8Q12308 EST1YLR233C 2100 nt3.22□□□□□ -1.89
TFC8Q12308 YAR009CYAR009C 3591 nt3.2□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 PET309YLR067C 2898 nt3.19□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt3.18□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 DNA2YHR164C 4569 nt3.16□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 RGC1YPR115W 3252 nt3.16□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 snR69snR69 101 nt3.16□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 YOR055WYOR055W 435 nt3.16□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 NUT1YGL151W 3399 nt3.15□□□□□ -1.9
TFC8Q12308 RTT101YJL047C 2529 nt3.14□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 RDS3YPR094W 324 nt3.14□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 SAC3YDR159W 3906 nt3.14□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YIL169CYIL169C 2988 nt3.13□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YER138CYER138C 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YER160CYER160C 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YJR027WYJR027W 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YML039WYML039W 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YML045WYML045W 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YMR050CYMR050C 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.11□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YSP2YDR326C 4317 nt3.1□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 EST2YLR318W 2655 nt3.1□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 SSD1YDR293C 3753 nt3.1□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 SXM1YDR395W 2835 nt3.1□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt3.1□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 PKH3YDR466W 2697 nt3.09□□□□□ -1.91
TFC8Q12308 SEC7YDR170C 6030 nt3.08□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt3.08□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 AXL1YPR122W 3627 nt3.08□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.07□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 snR14snR14 160 nt3.07□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 FLO1YAR050W 4614 nt3.07□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 KCS1YDR017C 3153 nt3.07□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 SPO14YKR031C 5052 nt3.07□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 YOR296WYOR296W 3870 nt3.06□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 UBR1YGR184C 5853 nt3.05□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 TFC3YAL001C 3483 nt3.04□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 FLO11YIR019C 4104 nt3.04□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 UTP21YLR409C 2820 nt3.03□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 CHC1YGL206C 4962 nt3.03□□□□□ -1.92
TFC8Q12308 CSE1YGL238W 2883 nt3.02□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 RAD50YNL250W 3939 nt3.02□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 PRP16YKR086W 3216 nt3.02□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 MSH6YDR097C 3729 nt3.02□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 DYN1YKR054C 12279 nt3.01□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 ULP2YIL031W 3105 nt3□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 TDA9YML081W 3756 nt3□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 KIP1YBL063W 3336 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.99□□□□□ -1.93
TFC8Q12308 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms