Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	YKL202W	YKL202W	582 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	SGF11	YPL047W	300 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
SMC4	Q12267	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	VAM3	YOR106W	852 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	snR5	snR5	204 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YDR220C	YDR220C	294 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YGL239C	YGL239C	315 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YMR254C	YMR254C	309 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	SPC24	YMR117C	642 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	snR51	snR51	107 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YHL041W	YHL041W	450 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	CMC1	YKL137W	336 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YLR282C	YLR282C	342 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
SMC4	Q12267	YJL182C	YJL182C	318 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	ILM1	YJR118C	612 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	YCR100C	YCR100C	951 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	AGA2	YGL032C	264 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	YPT6	YLR262C	648 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	POP7	YBR167C	423 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
SMC4	Q12267	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	BUD26	YDR241W	288 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YGL015C	YGL015C	393 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	MND1	YGL183C	660 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YNL058C	YNL058C	951 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YER084W-A	YER084W-A	513 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YGL182C	YGL182C	324 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YCR001W	YCR001W	315 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YER135C	YER135C	393 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	CUP1-1	YHR053C	186 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	CUP1-2	YHR055C	186 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YDR366C	YDR366C	399 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YPR039W	YPR039W	336 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
SMC4	Q12267	YHR130C	YHR130C	336 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	APQ13	YJL075C	417 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	ZEO1	YOL109W	342 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	MRPL32	YCR003W	552 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YBL062W	YBL062W	381 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	HMRA2	YCR096C	360 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YGL230C	YGL230C	444 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	snR49	snR49	165 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YIL032C	YIL032C	357 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YPL182C	YPL182C	384 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	FYV7	YLR068W	456 nt		-1.66	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		-1.66	□□□□□ -2.67
SMC4	Q12267	SRB7	YDR308C	423 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	APQ12	YIL040W	417 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	ATG16	YMR159C	453 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	YFL063W	YFL063W	456 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	HUR1	YGL168W	333 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	SCEI	Q0160	708 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
SMC4	Q12267	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	AIM29	YKR074W	468 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YLR334C	YLR334C	381 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YOR170W	YOR170W	306 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YKL083W	YKL083W	615 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
SMC4	Q12267	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YNL303W	YNL303W	348 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YGL052W	YGL052W	306 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YGR025W	YGR025W	303 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	YJR087W	YJR087W	351 nt		-1.83	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	snR189	snR189	189 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
SMC4	Q12267	snR74	snR74	88 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YPL068C	YPL068C	882 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YDL011C	YDL011C	324 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YAR029W	YAR029W	225 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YDR426C	YDR426C	378 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YLR217W	YLR217W	324 nt		-1.91	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YPL229W	YPL229W	621 nt		-1.91	□□□□□ -2.71
SMC4	Q12267	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
SMC4	Q12267	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
SMC4	Q12267	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
SMC4	Q12267	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-1.93	□□□□□ -2.72

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