Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 OLI1Q0130 231 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YOR376WYOR376W 369 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 AHC1YOR023C 1701 nt1.25□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YDR521WYDR521W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.24□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YNL198CYNL198C 303 nt1.24□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 AIM44YPL158C 2277 nt1.24□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YLL054CYLL054C 2532 nt1.24□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 ECM12YHR021W-A 456 nt1.23□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.23□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YBR206WYBR206W 324 nt1.23□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 ISD11YER048W-A 285 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 ULI1YFR026C 510 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 SMC1YFL008W 3678 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 RSM22YKL155C 1887 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YDL206WYDL206W 2289 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 SLD3YGL113W 2007 nt1.22□□□□□ -2.21
TMS1Q12116 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.21□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 snR14snR14 160 nt1.21□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 TTI1YKL033W 3117 nt1.21□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 IFH1YLR223C 3258 nt1.21□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.2□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.2□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 FIG4YNL325C 2640 nt1.2□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 ROM2YLR371W 4071 nt1.2□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 CDC25YLR310C 4770 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 MMS4YBR098W 2076 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 RPS30BYOR182C 192 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 RAD9YDR217C 3930 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YAR009CYAR009C 3591 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 MDS3YGL197W 4464 nt1.19□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YOR345CYOR345C 351 nt1.18□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 UBP3YER151C 2739 nt1.17□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 ALY2YJL084C 3141 nt1.17□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YDL196WYDL196W 330 nt1.17□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.17□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 AZF1YOR113W 2745 nt1.17□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 NST1YNL091W 3723 nt1.16□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.16□□□□□ -2.22
TMS1Q12116 YGR151CYGR151C 336 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YJL182CYJL182C 318 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YOR225WYOR225W 330 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 snR52snR52 92 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 NUP145YGL092W 3954 nt1.15□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 SWI4YER111C 3282 nt1.14□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 TRM732YMR259C 4263 nt1.14□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 SEC3YER008C 4011 nt1.14□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 Q0032Q0032 291 nt1.13□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.13□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 STO1YMR125W 2586 nt1.13□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 QCR9YGR183C 201 nt1.12□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.12□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 RPL33BYOR234C 324 nt1.12□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 GEA2YEL022W 4380 nt1.12□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YJL150WYJL150W 303 nt1.11□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.11□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 SIP4YJL089W 2490 nt1.11□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 SET3YKR029C 2256 nt1.1□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 APL1YJR005W 2103 nt1.1□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 APL3YBL037W 3078 nt1.1□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 WAR1YML076C 2835 nt1.1□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 NUP188YML103C 4968 nt1.09□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 PAN2YGL094C 3348 nt1.09□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 PAA1YDR071C 576 nt1.09□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YNL211CYNL211C 261 nt1.09□□□□□ -2.23
TMS1Q12116 YLL020CYLL020C 306 nt1.08□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.08□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YNL338WYNL338W 159 nt1.08□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.07□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 EAF1YDR359C 2949 nt1.06□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.06□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YLR294CYLR294C 330 nt1.06□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.06□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 snR46snR46 197 nt1.06□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 PRP39YML046W 1890 nt1.05□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 COY1YKL179C 2040 nt1.05□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 TRS65YGR166W 1683 nt1.05□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.05□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 PMP1YCR024C-A 123 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YEL073CYEL073C 324 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 COX12YLR038C 252 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 CMC4YMR194C-B 222 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 UTP20YBL004W 7482 nt1.03□□□□□ -2.24
TMS1Q12116 CDC39YCR093W 6327 nt1.02□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 STB6YKL072W 2301 nt1.01□□□□□ -2.25
TMS1Q12116 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.01□□□□□ -2.25
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