Protein–RNA interactions for Protein: Q12025

YDR056C, Uncharacterized protein YDR056C, yeastyeast

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR056CQ12025 RPL26BYGR034W 384 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR056CQ12025 COG8YML071C 1824 nt1.03□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 STE5YDR103W 2754 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 PMP1YCR024C-A 123 nt1.01□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YER097WYER097W 330 nt1.01□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 MCM10YIL150C 1716 nt1.01□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 EMT1tM(CAU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 EMT4tM(CAU)M 73 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 LTE1YAL024C 4308 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YNL028WYNL028W 318 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 INA22YIR024C 651 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YNL211CYNL211C 261 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 SGF11YPL047W 300 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YDR056CQ12025 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.96□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 SEC8YPR055W 3198 nt0.94□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 BFR2YDR299W 1605 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 PRP16YKR086W 3216 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 BEM2YER155C 6504 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 PAM16YJL104W 450 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 YDL073WYDL073W 2955 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 UBP3YER151C 2739 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR056CQ12025 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 NPR2YEL062W 1848 nt0.89□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.89□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.88□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.88□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.87□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 SEC1YDR164C 2175 nt0.87□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 Q0142Q0142 177 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 DOP1YDR141C 5097 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 RAD61YDR014W 1944 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 STF2YGR008C 255 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 HUG1YML058W-A 207 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 ASE1YOR058C 2658 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.84□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.84□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.84□□□□□ -2.27
YDR056CQ12025 BUD3YCL014W 4911 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 snR190snR190 190 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 CHS6YJL099W 2241 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.82□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 snR65snR65 100 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 HAL9YOL089C 3093 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 BEM3YPL115C 3387 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 COX5BYIL111W 456 nt0.8□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YNL146WYNL146W 303 nt0.79□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 FYV10YIL097W 1551 nt0.79□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YGR069WYGR069W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YPR092WYPR092W 306 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YML002WYML002W 2214 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR056CQ12025 YGL052WYGL052W 306 nt0.76□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 BLI1YKL061W 342 nt0.76□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YLR282CYLR282C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.76□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YOR015WYOR015W 360 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 RPS30BYOR182C 192 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 MLP1YKR095W 5628 nt0.74□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.72□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.72□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 COY1YKL179C 2040 nt0.72□□□□□ -2.29
YDR056CQ12025 OST4YDL232W 111 nt0.71□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 PRP42YDR235W 1635 nt0.71□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.69□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 YCR022CYCR022C 345 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 IQG1YPL242C 4488 nt0.68□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 PET111YMR257C 2403 nt0.67□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 YSP1YHR155W 3687 nt0.66□□□□□ -2.3
YDR056CQ12025 ULI1YFR026C 510 nt0.64□□□□□ -2.31
YDR056CQ12025 snR74snR74 88 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms