Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 BFR2YDR299W 1605 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 DBP6YNR038W 1890 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 ALG13YGL047W 609 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YJL120WYJL120W 324 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 SGF11YPL047W 300 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 MYO1YHR023W 5787 nt0.78□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YDL073WYDL073W 2955 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 snR36snR36 182 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 snR60snR60 104 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 ISD11YER048W-A 285 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 CMC4YMR194C-B 222 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YNL211CYNL211C 261 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 COG8YML071C 1824 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 NHP2YDL208W 471 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YFL032WYFL032W 321 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 NOP9YJL010C 2001 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YOR282WYOR282W 321 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YPL044CYPL044C 549 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN8Q08723 YIL032CYIL032C 357 nt0.71□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 VIK1YPL253C 1944 nt0.7□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YDR413CYDR413C 576 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YMR321CYMR321C 318 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 ASE1YOR058C 2658 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 HTL1YCR020W-B 237 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 ATP6Q0085 780 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YGL149WYGL149W 306 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 RPS27BYHR021C 249 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 PMP1YCR024C-A 123 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YFL063WYFL063W 456 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YKL118WYKL118W 312 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.67□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 NPR2YEL062W 1848 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 BIR1YJR089W 2865 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 PRP16YKR086W 3216 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 PAA1YDR071C 576 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YOR218CYOR218C 420 nt0.66□□□□□ -2.3
RPN8Q08723 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.65□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YER097WYER097W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 CHS6YJL099W 2241 nt0.65□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.64□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 CSE2YNR010W 450 nt0.64□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 TRS65YGR166W 1683 nt0.64□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 RPL26BYGR034W 384 nt0.63□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 LTE1YAL024C 4308 nt0.62□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YML002WYML002W 2214 nt0.62□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.61□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YKL136WYKL136W 399 nt0.61□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.6□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YOR015WYOR015W 360 nt0.6□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 STE5YDR103W 2754 nt0.6□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.59□□□□□ -2.31
RPN8Q08723 AI1Q0050 2505 nt0.59□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YNL028WYNL028W 318 nt0.58□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 snR190snR190 190 nt0.58□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 COX5BYIL111W 456 nt0.57□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.57□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 COY1YKL179C 2040 nt0.56□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 FYV10YIL097W 1551 nt0.56□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 RAD61YDR014W 1944 nt0.56□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.55□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 RPL39YJL189W 156 nt0.55□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.55□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.54□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 ULP2YIL031W 3105 nt0.53□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 SEC8YPR055W 3198 nt0.53□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YGR069WYGR069W 336 nt0.53□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.53□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 PRP5YBR237W 2550 nt0.53□□□□□ -2.32
RPN8Q08723 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YLR282CYLR282C 342 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.52□□□□□ -2.33
RPN8Q08723 YPR092WYPR092W 306 nt0.52□□□□□ -2.33
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