Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 STO1YMR125W 2586 nt1.28□□□□□ -2.2
SSK1Q07084 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.27□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.27□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.27□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.27□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 CDC25YLR310C 4770 nt1.26□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 CDC31YOR257W 486 nt1.26□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 CDC39YCR093W 6327 nt1.26□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 LAA1YJL207C 6045 nt1.25□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 AZF1YOR113W 2745 nt1.25□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 PAM16YJL104W 450 nt1.25□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.25□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YDL196WYDL196W 330 nt1.24□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.24□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.23□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 MSN5YDR335W 3675 nt1.22□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.22□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 RAD9YDR217C 3930 nt1.22□□□□□ -2.21
SSK1Q07084 NUP145YGL092W 3954 nt1.21□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 ISD11YER048W-A 285 nt1.21□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 OLI1Q0130 231 nt1.21□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YLL020CYLL020C 306 nt1.21□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.2□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YNL211CYNL211C 261 nt1.2□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 EAF1YDR359C 2949 nt1.19□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 WAR1YML076C 2835 nt1.19□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 STB6YKL072W 2301 nt1.19□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YOR345CYOR345C 351 nt1.19□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.18□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.18□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 PAA1YDR071C 576 nt1.17□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 APL1YJR005W 2103 nt1.17□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.17□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 RSM22YKL155C 1887 nt1.16□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 SEC3YER008C 4011 nt1.16□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.16□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 ULI1YFR026C 510 nt1.16□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 NUP157YER105C 4176 nt1.16□□□□□ -2.22
SSK1Q07084 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.15□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 CMC4YMR194C-B 222 nt1.15□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 MSH3YCR092C 3057 nt1.14□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 RPL33BYOR234C 324 nt1.14□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 NOP9YJL010C 2001 nt1.14□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 GEA2YEL022W 4380 nt1.14□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 HAL9YOL089C 3093 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 COX12YLR038C 252 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 RPS30BYOR182C 192 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 ASE1YOR058C 2658 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 SMC1YFL008W 3678 nt1.13□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.12□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 YEL014CYEL014C 306 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 YNL337WYNL337W 255 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 TTI1YKL033W 3117 nt1.11□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 KAP120YPL125W 3099 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 snR46snR46 197 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 ROM2YLR371W 4071 nt1.1□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 CLU1YMR012W 3834 nt1.09□□□□□ -2.23
SSK1Q07084 COY1YKL179C 2040 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YPL044CYPL044C 549 nt1.08□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YJL150WYJL150W 303 nt1.07□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YNL198CYNL198C 303 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.06□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.05□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 RPL26BYGR034W 384 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 SPT7YBR081C 3999 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YGR130CYGR130C 2451 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 PMP1YCR024C-A 123 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YLR282CYLR282C 342 nt1.03□□□□□ -2.24
SSK1Q07084 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 YJL182CYJL182C 318 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 snR52snR52 92 nt1.02□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 COX5BYIL111W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 snR190snR190 190 nt1.01□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 BFR2YDR299W 1605 nt1□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 YOR225WYOR225W 330 nt1□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 PRP16YKR086W 3216 nt1□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 PRP39YML046W 1890 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SSK1Q07084 DOP1YDR141C 5097 nt0.98□□□□□ -2.25
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