Protein–RNA interactions for Protein: P43625

YFR057W, Uncharacterized protein YFR057W, yeastyeast

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR057WP43625 RPL33BYOR234C 324 nt0.94□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 NST1YNL091W 3723 nt0.93□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.93□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 YGL041CYGL041C 204 nt0.93□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 LAA1YJL207C 6045 nt0.92□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.92□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.92□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 CMC4YMR194C-B 222 nt0.92□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 NPR2YEL062W 1848 nt0.92□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 CLU1YMR012W 3834 nt0.91□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 NOP9YJL010C 2001 nt0.91□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 ROM2YLR371W 4071 nt0.9□□□□□ -2.26
YFR057WP43625 CAT8YMR280C 4302 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YDL073WYDL073W 2955 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 snR80snR80 171 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YDL196WYDL196W 330 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 snR8snR8 190 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.89□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.89□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 ABF2YMR072W 552 nt0.89□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YJR029WYJR029W 5268 nt0.89□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.89□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.88□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.88□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YPL044CYPL044C 549 nt0.88□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 PRP16YKR086W 3216 nt0.87□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 snR55snR55 98 nt0.87□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.87□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.87□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 SPT7YBR081C 3999 nt0.87□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 BUD3YCL014W 4911 nt0.86□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 VAM6YDL077C 3150 nt0.86□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 BFR2YDR299W 1605 nt0.86□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 PAA1YDR071C 576 nt0.85□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YDR366CYDR366C 399 nt0.85□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 ISD11YER048W-A 285 nt0.85□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 SMC1YFL008W 3678 nt0.85□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YOR302WYOR302W 78 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 YCL023CYCL023C 348 nt0.84□□□□□ -2.27
YFR057WP43625 RKR1YMR247C 4689 nt0.83□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 PMP1YCR024C-A 123 nt0.83□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 MSH3YCR092C 3057 nt0.83□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YKU70YMR284W 1809 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YGR130CYGR130C 2451 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 BEM2YER155C 6504 nt0.82□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 RPL26BYGR034W 384 nt0.81□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 RPS30BYOR182C 192 nt0.8□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YOR345CYOR345C 351 nt0.8□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 COY1YKL179C 2040 nt0.79□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 TTI1YKL033W 3117 nt0.79□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.79□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 COX12YLR038C 252 nt0.78□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.78□□□□□ -2.28
YFR057WP43625 NUP192YJL039C 5052 nt0.78□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 snR190snR190 190 nt0.77□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YPR117WYPR117W 7470 nt0.77□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 SCC2YDR180W 4482 nt0.76□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YLR282CYLR282C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 HAL9YOL089C 3093 nt0.76□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.75□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.75□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 ULI1YFR026C 510 nt0.74□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 SEC8YPR055W 3198 nt0.73□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 COX5BYIL111W 456 nt0.73□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.73□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 CHS6YJL099W 2241 nt0.72□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.72□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 BLI1YKL061W 342 nt0.72□□□□□ -2.29
YFR057WP43625 APQ12YIL040W 417 nt0.71□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YLR041WYLR041W 321 nt0.71□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YPP1YGR198W 2454 nt0.71□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 FYV10YIL097W 1551 nt0.7□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.7□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.7□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.7□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 YML002WYML002W 2214 nt0.68□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 OST4YDL232W 111 nt0.66□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.66□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.66□□□□□ -2.3
YFR057WP43625 SIP4YJL089W 2490 nt0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms