Protein–RNA interactions for Protein: P40082

YER135C, Uncharacterized protein YER135C, yeastyeast

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER135CP40082 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
YER135CP40082 TAR1YLR154W-C 375 nt0.46□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YMR321CYMR321C 318 nt0.46□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YPL044CYPL044C 549 nt0.46□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YPR197CYPR197C 564 nt0.46□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 LTE1YAL024C 4308 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 STF2YGR008C 255 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YPL225WYPL225W 441 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 snR36snR36 182 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YML002WYML002W 2214 nt0.45□□□□□ -2.34
YER135CP40082 NOP9YJL010C 2001 nt0.44□□□□□ -2.34
YER135CP40082 ISD11YER048W-A 285 nt0.44□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YJL120WYJL120W 324 nt0.44□□□□□ -2.34
YER135CP40082 COG8YML071C 1824 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 GIM4YEL003W 336 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 RPL26BYGR034W 384 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YHL042WYHL042W 453 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YOR282WYOR282W 321 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 CHS6YJL099W 2241 nt0.43□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YDR102CYDR102C 333 nt0.42□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.42□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.42□□□□□ -2.34
YER135CP40082 RPS30BYOR182C 192 nt0.42□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YPR012WYPR012W 255 nt0.42□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YSP1YHR155W 3687 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 UBP3YER151C 2739 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 VIK1YPL253C 1944 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 PAN2YGL094C 3348 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YFL032WYFL032W 321 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YIL032CYIL032C 357 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 HUG1YML058W-A 207 nt0.41□□□□□ -2.34
YER135CP40082 YMR160WYMR160W 2451 nt0.4□□□□□ -2.35
YER135CP40082 snR56snR56 88 nt0.4□□□□□ -2.35
YER135CP40082 PMP1YCR024C-A 123 nt0.4□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.4□□□□□ -2.35
YER135CP40082 RPS27BYHR021C 249 nt0.39□□□□□ -2.35
YER135CP40082 ASE1YOR058C 2658 nt0.39□□□□□ -2.35
YER135CP40082 HMRA1YCR097W 381 nt0.38□□□□□ -2.35
YER135CP40082 PAA1YDR071C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YDR413CYDR413C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YOR218CYOR218C 420 nt0.38□□□□□ -2.35
YER135CP40082 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.37□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.37□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YPR092WYPR092W 306 nt0.37□□□□□ -2.35
YER135CP40082 COY1YKL179C 2040 nt0.37□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YGL149WYGL149W 306 nt0.36□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.36□□□□□ -2.35
YER135CP40082 CSE2YNR010W 450 nt0.36□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.36□□□□□ -2.35
YER135CP40082 snR190snR190 190 nt0.36□□□□□ -2.35
YER135CP40082 PRP5YBR237W 2550 nt0.35□□□□□ -2.35
YER135CP40082 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.35□□□□□ -2.35
YER135CP40082 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.35□□□□□ -2.35
YER135CP40082 COX5BYIL111W 456 nt0.35□□□□□ -2.35
YER135CP40082 FYV10YIL097W 1551 nt0.34□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.34□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YKL136WYKL136W 399 nt0.34□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.33□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YOR015WYOR015W 360 nt0.33□□□□□ -2.36
YER135CP40082 SBH1YER087C-B 249 nt0.32□□□□□ -2.36
YER135CP40082 ABF2YMR072W 552 nt0.32□□□□□ -2.36
YER135CP40082 PET111YMR257C 2403 nt0.32□□□□□ -2.36
YER135CP40082 HTL1YCR020W-B 237 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YFL063WYFL063W 456 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 ULI1YFR026C 510 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 PAU12YGR294W 363 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YKL118WYKL118W 312 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YLR282CYLR282C 342 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.31□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 ATP6Q0085 780 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YER097WYER097W 330 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YNL028WYNL028W 318 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YOR345CYOR345C 351 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 RAD61YDR014W 1944 nt0.3□□□□□ -2.36
YER135CP40082 snR74snR74 88 nt0.29□□□□□ -2.36
YER135CP40082 OST4YDL232W 111 nt0.29□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YGR069WYGR069W 336 nt0.29□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.29□□□□□ -2.36
YER135CP40082 PRP42YDR235W 1635 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 ORC3YLL004W 1851 nt0.28□□□□□ -2.36
YER135CP40082 SEC8YPR055W 3198 nt0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.4 ms