Protein–RNA interactions for Protein: P38206

RFT1, Oligosaccharide translocation protein RFT1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFT1P38206 PAM16YJL104W 450 nt0.76□□□□□ -2.29
RFT1P38206 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.75□□□□□ -2.29
RFT1P38206 DBP6YNR038W 1890 nt0.74□□□□□ -2.29
RFT1P38206 ALG13YGL047W 609 nt0.74□□□□□ -2.29
RFT1P38206 YPL225WYPL225W 441 nt0.74□□□□□ -2.29
RFT1P38206 INA22YIR024C 651 nt0.73□□□□□ -2.29
RFT1P38206 BFR2YDR299W 1605 nt0.73□□□□□ -2.29
RFT1P38206 NOP9YJL010C 2001 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 HTL1YCR020W-B 237 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 YMR321CYMR321C 318 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 IES4YOR189W 351 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 YOR282WYOR282W 321 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 YPL044CYPL044C 549 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 snR36snR36 182 nt0.72□□□□□ -2.29
RFT1P38206 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.71□□□□□ -2.3
RFT1P38206 SGF11YPL047W 300 nt0.71□□□□□ -2.3
RFT1P38206 PRP16YKR086W 3216 nt0.71□□□□□ -2.3
RFT1P38206 COG8YML071C 1824 nt0.71□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YNL211CYNL211C 261 nt0.7□□□□□ -2.3
RFT1P38206 ASE1YOR058C 2658 nt0.69□□□□□ -2.3
RFT1P38206 PMP1YCR024C-A 123 nt0.69□□□□□ -2.3
RFT1P38206 snR60snR60 104 nt0.69□□□□□ -2.3
RFT1P38206 ATP6Q0085 780 nt0.69□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
RFT1P38206 PAA1YDR071C 576 nt0.68□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YFL032WYFL032W 321 nt0.68□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YFL063WYFL063W 456 nt0.68□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.68□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YIL032CYIL032C 357 nt0.68□□□□□ -2.3
RFT1P38206 STF2YGR008C 255 nt0.67□□□□□ -2.3
RFT1P38206 RPS27BYHR021C 249 nt0.67□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.67□□□□□ -2.3
RFT1P38206 VIK1YPL253C 1944 nt0.67□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YKL118WYKL118W 312 nt0.66□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.66□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YMR160WYMR160W 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
RFT1P38206 LTE1YAL024C 4308 nt0.65□□□□□ -2.3
RFT1P38206 YDR413CYDR413C 576 nt0.65□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YGL149WYGL149W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YOR218CYOR218C 420 nt0.65□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YER097WYER097W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
RFT1P38206 RPL26BYGR034W 384 nt0.63□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.63□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YKL136WYKL136W 399 nt0.63□□□□□ -2.31
RFT1P38206 CSE2YNR010W 450 nt0.63□□□□□ -2.31
RFT1P38206 RPS30BYOR182C 192 nt0.63□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.62□□□□□ -2.31
RFT1P38206 CHS6YJL099W 2241 nt0.62□□□□□ -2.31
RFT1P38206 NPR2YEL062W 1848 nt0.61□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.61□□□□□ -2.31
RFT1P38206 STE5YDR103W 2754 nt0.6□□□□□ -2.31
RFT1P38206 RPL39YJL189W 156 nt0.6□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.6□□□□□ -2.31
RFT1P38206 UTP20YBL004W 7482 nt0.6□□□□□ -2.31
RFT1P38206 FMP27YLR454W 7887 nt0.59□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.59□□□□□ -2.31
RFT1P38206 HUG1YML058W-A 207 nt0.59□□□□□ -2.31
RFT1P38206 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.58□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YNL028WYNL028W 318 nt0.58□□□□□ -2.32
RFT1P38206 ULP2YIL031W 3105 nt0.58□□□□□ -2.32
RFT1P38206 MYO1YHR023W 5787 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 SEC8YPR055W 3198 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YOR015WYOR015W 360 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YML002WYML002W 2214 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.57□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.56□□□□□ -2.32
RFT1P38206 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
RFT1P38206 FYV10YIL097W 1551 nt0.55□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.55□□□□□ -2.32
RFT1P38206 snR190snR190 190 nt0.55□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.54□□□□□ -2.32
RFT1P38206 PRP5YBR237W 2550 nt0.54□□□□□ -2.32
RFT1P38206 RAD61YDR014W 1944 nt0.54□□□□□ -2.32
RFT1P38206 HAL9YOL089C 3093 nt0.53□□□□□ -2.32
RFT1P38206 COX5BYIL111W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.53□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.53□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
RFT1P38206 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.51□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.51□□□□□ -2.33
RFT1P38206 COY1YKL179C 2040 nt0.5□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YLR282CYLR282C 342 nt0.5□□□□□ -2.33
RFT1P38206 OST4YDL232W 111 nt0.49□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YGL052WYGL052W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YGR069WYGR069W 336 nt0.48□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.48□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.48□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YPR092WYPR092W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
RFT1P38206 PRP42YDR235W 1635 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 ULI1YFR026C 510 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
RFT1P38206 snR74snR74 88 nt0.46□□□□□ -2.34
RFT1P38206 YOR345CYOR345C 351 nt0.46□□□□□ -2.34
RFT1P38206 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.1 ms