Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNE4Q8N205 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNE4Q8N205 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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