Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 VPS8YAL002W 3825 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 MET18YIL128W 3099 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 DGR2YKL121W 2559 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 PBY1YBR094W 2262 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YNL018CYNL018C 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 MDS3YGL197W 4464 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YOL098CYOL098C 3114 nt2.46□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 SAP185YJL098W 3177 nt2.45□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YFR016CYFR016C 3702 nt2.45□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.45□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 CHC1YGL206C 4962 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 MSH5YDL154W 2706 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 SGS1YMR190C 4344 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 OST4YDL232W 111 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 SBH1YER087C-B 249 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.44□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 snR70snR70 164 nt2.43□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YNL211CYNL211C 261 nt2.43□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 PDR3YBL005W 2931 nt2.43□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 ALK1YGL021W 2283 nt2.43□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 SVL3YPL032C 2478 nt2.42□□□□□ -2.02
YLL054CQ12244 YLR282CYLR282C 342 nt2.4□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YOR055WYOR055W 435 nt2.4□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YLR419WYLR419W 4308 nt2.4□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 PTP2YOR208W 2253 nt2.4□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 VPS13YLL040C 9435 nt2.4□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 PDR11YIL013C 4236 nt2.38□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YDL118WYDL118W 381 nt2.38□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 BUB1YGR188C 3066 nt2.38□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 CMC4YMR194C-B 222 nt2.38□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 MLH3YPL164C 2148 nt2.37□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 RAV1YJR033C 4074 nt2.37□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YPR097WYPR097W 3222 nt2.37□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 GIP3YPL137C 3831 nt2.37□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 IRC8YJL051W 2469 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 NUP100YKL068W 2880 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YLL054CYLL054C 2532 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 DCP2YNL118C 2913 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 SMC6YLR383W 3345 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.36□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 SAP190YKR028W 3102 nt2.35□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 MAK10YEL053C 2202 nt2.35□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 SBE22YHR103W 2559 nt2.35□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 HMI1YOL095C 2121 nt2.35□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 YOR019WYOR019W 2193 nt2.34□□□□□ -2.03
YLL054CQ12244 PRP5YBR237W 2550 nt2.34□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YPP1YGR198W 2454 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 TUS1YLR425W 3924 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 TTI1YKL033W 3117 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 STE11YLR362W 2154 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 NAB6YML117W 3405 nt2.33□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 SLN1YIL147C 3663 nt2.32□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.32□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 STB6YKL072W 2301 nt2.32□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 SCD5YOR329C 2619 nt2.32□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 HIR3YJR140C 4947 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 SEC16YPL085W 6588 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 COG4YPR105C 2586 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 NUP157YER105C 4176 nt2.31□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 SCP160YJL080C 3669 nt2.3□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 SOM1YEL059C-A 225 nt2.3□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 UBP1YDL122W 2430 nt2.3□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 AGC1YPR021C 2709 nt2.3□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 NUP170YBL079W 4509 nt2.3□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 DNF1YER166W 4716 nt2.29□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 CHS6YJL099W 2241 nt2.29□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 LHS1YKL073W 2646 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 TRL1YJL087C 2484 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 PKH2YOL100W 3246 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 YGL182CYGL182C 324 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 MSB1YOR188W 3414 nt2.28□□□□□ -2.04
YLL054CQ12244 BPH1YCR032W 6504 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 RCO1YMR075W 2055 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 SYH1YPL105C 2550 nt2.27□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 YNL144CYNL144C 2223 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 UBP2YOR124C 3819 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 RPL37BYDR500C 267 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 SPP41YDR464W 4308 nt2.26□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 APL1YJR005W 2103 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 NEO1YIL048W 3456 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 SLI15YBR156C 2097 nt2.25□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 RTT107YHR154W 3213 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 snR39BsnR39B 96 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 POL5YEL055C 3069 nt2.24□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 SSD1YDR293C 3753 nt2.23□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 EAF1YDR359C 2949 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.22□□□□□ -2.05
YLL054CQ12244 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.22□□□□□ -2.05
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