Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 LTE1YAL024C 4308 nt0.88□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 DBP6YNR038W 1890 nt0.88□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 NIP100YPL174C 2607 nt0.87□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.87□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YPL205CYPL205C 345 nt0.87□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.86□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YLL007CYLL007C 1998 nt0.85□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YGR042WYGR042W 816 nt0.85□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 IES4YOR189W 351 nt0.85□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 MAM33YIL070C 801 nt0.84□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 PAU24YBR301W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
NFI1Q12216 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.83□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YLR202CYLR202C 327 nt0.81□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YNL324WYNL324W 396 nt0.81□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 PCC1YKR095W-A 267 nt0.8□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YPL068CYPL068C 882 nt0.8□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 SWF1YDR126W 1011 nt0.79□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.79□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YDR521WYDR521W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
NFI1Q12216 YPL044CYPL044C 549 nt0.77□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 SEC1YDR164C 2175 nt0.76□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 PMP1YCR024C-A 123 nt0.76□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YJR011CYJR011C 786 nt0.76□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YDR426CYDR426C 378 nt0.75□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.75□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YLR434CYLR434C 384 nt0.75□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.75□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.75□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 NOP9YJL010C 2001 nt0.74□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 HMRA2YCR096C 360 nt0.73□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 PAA1YDR071C 576 nt0.73□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.72□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 PRM3YPL192C 402 nt0.72□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 GEA2YEL022W 4380 nt0.72□□□□□ -2.29
NFI1Q12216 SPO21YOL091W 1830 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YCK3YER123W 1575 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 OLI1Q0130 231 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 VPS20YMR077C 666 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YBR064WYBR064W 429 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 BFR2YDR299W 1605 nt0.71□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 ECM12YHR021W-A 456 nt0.7□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.7□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YOR053WYOR053W 342 nt0.7□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 AGA2YGL032C 264 nt0.69□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.69□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 RKR1YMR247C 4689 nt0.69□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YBR206WYBR206W 324 nt0.69□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 BSC3YLR465C 309 nt0.68□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YOR218CYOR218C 420 nt0.68□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 IQG1YPL242C 4488 nt0.68□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YDR344CYDR344C 444 nt0.67□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.67□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 CMC4YMR194C-B 222 nt0.67□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 BEM3YPL115C 3387 nt0.67□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 NPR2YEL062W 1848 nt0.66□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 RPL26BYGR034W 384 nt0.66□□□□□ -2.3
NFI1Q12216 YBR285WYBR285W 435 nt0.65□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 OST1YJL002C 1431 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 CHS6YJL099W 2241 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.63□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 MYO1YHR023W 5787 nt0.63□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 FMP27YLR454W 7887 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 MCM10YIL150C 1716 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YER079WYER079W 633 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YOR121CYOR121C 306 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YML002WYML002W 2214 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 MLP1YKR095W 5628 nt0.62□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YSP1YHR155W 3687 nt0.61□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 SEC8YPR055W 3198 nt0.6□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 UTP20YBL004W 7482 nt0.6□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.59□□□□□ -2.31
NFI1Q12216 MLP2YIL149C 5040 nt0.59□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YHR138CYHR138C 345 nt0.58□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 PAM16YJL104W 450 nt0.58□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YLR334CYLR334C 381 nt0.58□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 HAL9YOL089C 3093 nt0.57□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YJR157WYJR157W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 RPS25BYLR333C 327 nt0.56□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.56□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.55□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.55□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 ASE1YOR058C 2658 nt0.54□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 FYV10YIL097W 1551 nt0.54□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YJL120WYJL120W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.54□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YAR029WYAR029W 225 nt0.54□□□□□ -2.32
NFI1Q12216 YPL225WYPL225W 441 nt0.54□□□□□ -2.32
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