Protein–RNA interactions for Protein: Q12106

MCP1, MDM10-complementing protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCP1Q12106 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 ULP2YIL031W 3105 nt0.44□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 SDH7YDR511W 402 nt0.42□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 YIR044CYIR044C 186 nt0.42□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 YPL229WYPL229W 621 nt0.42□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 NPR2YEL062W 1848 nt0.42□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 PMP1YCR024C-A 123 nt0.41□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.41□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 YNL058CYNL058C 951 nt0.41□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 DIE2YGR227W 1578 nt0.4□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 NOP9YJL010C 2001 nt0.4□□□□□ -2.34
MCP1Q12106 INP2YMR163C 2118 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 CHS6YJL099W 2241 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YHL041WYHL041W 450 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YPL044CYPL044C 549 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 snR54snR54 86 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 LTE1YAL024C 4308 nt0.4□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 BI2Q0110 1272 nt0.39□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YCK3YER123W 1575 nt0.38□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 ECL1YGR146C 636 nt0.38□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YKL083WYKL083W 615 nt0.38□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.38□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 RPL26AYLR344W 384 nt0.38□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.37□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YNL122CYNL122C 348 nt0.37□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 OLI1Q0130 231 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YGR290WYGR290W 444 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 RPS24BYIL069C 408 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 MAM33YIL070C 801 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YBR064WYBR064W 429 nt0.36□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 STE5YDR103W 2754 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 PTP2YOR208W 2253 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 RPL26BYGR034W 384 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 QCR9YGR183C 201 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YLR171WYLR171W 390 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YAR047CYAR047C 321 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 BSC3YLR465C 309 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 UBC7YMR022W 498 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
MCP1Q12106 CBS1YDL069C 690 nt0.34□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YAP6YDR259C 1152 nt0.34□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 MCM10YIL150C 1716 nt0.34□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 PCF11YDR228C 1881 nt0.33□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 FYV7YLR068W 456 nt0.33□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 AI1Q0050 2505 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YSP1YHR155W 3687 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YJR011CYJR011C 786 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YPL185WYPL185W 396 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 BIR1YJR089W 2865 nt0.32□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 ATG31YDR022C 591 nt0.31□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 RPS20YHL015W 366 nt0.31□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YBR206WYBR206W 324 nt0.31□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 SPO21YOL091W 1830 nt0.3□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 PAA1YDR071C 576 nt0.3□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YLR101CYLR101C 396 nt0.3□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YOL014WYOL014W 375 nt0.3□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 snR41snR41 95 nt0.3□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YDL158CYDL158C 309 nt0.29□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.29□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.29□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 THO2YNL139C 4794 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 TRS65YGR166W 1683 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 PAU12YGR294W 363 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 ISF1YMR081C 1017 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 TOM22YNL131W 459 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 PET111YMR257C 2403 nt0.28□□□□□ -2.36
MCP1Q12106 NIP100YPL174C 2607 nt0.28□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 FYV10YIL097W 1551 nt0.28□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 IQG1YPL242C 4488 nt0.27□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 MYO1YHR023W 5787 nt0.24□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 YDR426CYDR426C 378 nt0.24□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 MRPL50YNR022C 420 nt0.24□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 VIK1YPL253C 1944 nt0.23□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.23□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 MLP1YKR095W 5628 nt0.22□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 COX5BYIL111W 456 nt0.22□□□□□ -2.37
MCP1Q12106 YLR456WYLR456W 615 nt0.21□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 YNL211CYNL211C 261 nt0.21□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.21□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 SEC8YPR055W 3198 nt0.21□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 ASE1YOR058C 2658 nt0.2□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 HMRA2YCR096C 360 nt0.2□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 PCC1YKR095W-A 267 nt0.2□□□□□ -2.38
MCP1Q12106 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms