Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 UBP3YER151C 2739 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN8Q08723 SLI15YBR156C 2097 nt1.03□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 SET3YKR029C 2256 nt1.03□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 STO1YMR125W 2586 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 SWI4YER111C 3282 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 RAD34YDR314C 2079 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 EAF1YDR359C 2949 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 AIM44YPL158C 2277 nt1□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 STB6YKL072W 2301 nt1□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 MAM33YIL070C 801 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YLR334CYLR334C 381 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 PKH2YOL100W 3246 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 GEA2YEL022W 4380 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YGR035CYGR035C 351 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YJR011CYJR011C 786 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 RPL38YLR325C 237 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YPL261CYPL261C 309 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YAR009CYAR009C 3591 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YBR012CYBR012C 420 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 SEC3YER008C 4011 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 MMS4YBR098W 2076 nt0.96□□□□□ -2.25
RPN8Q08723 YDL206WYDL206W 2289 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 RPL35AYDL191W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 PCC1YKR095W-A 267 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 BIL1YOR304C-A 231 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 OST1YJL002C 1431 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 NIP100YPL174C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 RIM20YOR275C 1986 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 PDE2YOR360C 1581 nt0.96□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 GPG1YGL121C 381 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 QCR9YGR183C 201 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 YPR012WYPR012W 255 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 IFH1YLR223C 3258 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 YAR029WYAR029W 225 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 UTP20YBL004W 7482 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 ALY2YJL084C 3141 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 HTB2YBL002W 396 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 CUL3YGR003W 2235 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 WAR1YML076C 2835 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 YBR206WYBR206W 324 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 YLL007CYLL007C 1998 nt0.9□□□□□ -2.26
RPN8Q08723 SMC1YFL008W 3678 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YDR048CYDR048C 315 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YCK3YER123W 1575 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YBR064WYBR064W 429 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YDR521WYDR521W 336 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 KAP120YPL125W 3099 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 GIM4YEL003W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 ECM12YHR021W-A 456 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YIR044CYIR044C 186 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YAF9YNL107W 681 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YPR197CYPR197C 564 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YCS4YLR272C 3531 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 HMRA1YCR097W 381 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 SSS1YDR086C 243 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YPR117WYPR117W 7470 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 RKR1YMR247C 4689 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 NUP157YER105C 4176 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YDR344CYDR344C 444 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YOL014WYOL014W 375 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 PTP2YOR208W 2253 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 snR56snR56 88 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN8Q08723 MCM10YIL150C 1716 nt0.84□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YMR160WYMR160W 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YDL196WYDL196W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.83□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 PAN2YGL094C 3348 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YDR102CYDR102C 333 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YPL225WYPL225W 441 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 HMRA2YCR096C 360 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 OLI1Q0130 231 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YHL042WYHL042W 453 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 TAR1YLR154W-C 375 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 RPS25BYLR333C 327 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 IES4YOR189W 351 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN8Q08723 SPO21YOL091W 1830 nt0.8□□□□□ -2.28
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