Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 RIM20YOR275C 1986 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 SLI15YBR156C 2097 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 INP2YMR163C 2118 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 NUP157YER105C 4176 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 COG4YPR105C 2586 nt0.63□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.63□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 CMC4YMR194C-B 222 nt0.63□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.63□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDL206WYDL206W 2289 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 RKR1YMR247C 4689 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 RPS20YHL015W 366 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YOR121CYOR121C 306 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 ATG31YDR022C 591 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDR157WYDR157W 402 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDR426CYDR426C 378 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDL073WYDL073W 2955 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 RAD34YDR314C 2079 nt0.61□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 PKH2YOL100W 3246 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 MMS4YBR098W 2076 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 GEA2YEL022W 4380 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDL196WYDL196W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 CSN9YDR179C 489 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YPL261CYPL261C 309 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 PDE2YOR360C 1581 nt0.6□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 MAM33YIL070C 801 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YAR053WYAR053W 297 nt0.59□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 GPG1YGL121C 381 nt0.58□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 RPL38YLR325C 237 nt0.58□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 ALY2YJL084C 3141 nt0.58□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 WAR1YML076C 2835 nt0.57□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YJR011CYJR011C 786 nt0.57□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 CUL3YGR003W 2235 nt0.56□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YFL019CYFL019C 354 nt0.56□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 PCC1YKR095W-A 267 nt0.56□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 NIP100YPL174C 2607 nt0.55□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.55□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 INA22YIR024C 651 nt0.55□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YAR029WYAR029W 225 nt0.55□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 PRP16YKR086W 3216 nt0.54□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 RPL35AYDL191W 363 nt0.54□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 BIL1YOR304C-A 231 nt0.54□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YBR206WYBR206W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YGR035CYGR035C 351 nt0.53□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YIR044CYIR044C 186 nt0.53□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YBR064WYBR064W 429 nt0.53□□□□□ -2.32
NUP49Q02199 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YDR344CYDR344C 444 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YOR029WYOR029W 336 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 IES4YOR189W 351 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.52□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YCK3YER123W 1575 nt0.51□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 PAN2YGL094C 3348 nt0.51□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 HTB2YBL002W 396 nt0.51□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 PTP2YOR208W 2253 nt0.51□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.51□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 UBP3YER151C 2739 nt0.5□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YDR048CYDR048C 315 nt0.5□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 ALG13YGL047W 609 nt0.5□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YLR334CYLR334C 381 nt0.5□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 DBP6YNR038W 1890 nt0.5□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 OST1YJL002C 1431 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 OLI1Q0130 231 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YHL042WYHL042W 453 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 RPS30BYOR182C 192 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 LTE1YAL024C 4308 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 MCM10YIL150C 1716 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 SSS1YDR086C 243 nt0.48□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 STF2YGR008C 255 nt0.48□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.48□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YPR012WYPR012W 255 nt0.48□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 HMRA2YCR096C 360 nt0.47□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.47□□□□□ -2.33
NUP49Q02199 RPS25BYLR333C 327 nt0.47□□□□□ -2.33
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