Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 snR13snR13 124 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YPL182CYPL182C 384 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 MCM10YIL150C 1716 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 OLI1Q0130 231 nt-0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 RPB10YOR210W 213 nt-0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 CUL3YGR003W 2235 nt-0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 STE5YDR103W 2754 nt-0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YGR025WYGR025W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YLR198CYLR198C 360 nt-0.03□□□□□ -2.41
GIM3P53900 PBI2YNL015W 228 nt-0.03□□□□□ -2.41
GIM3P53900 PRP5YBR237W 2550 nt-0.04□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YAP6YDR259C 1152 nt-0.05□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.05□□□□□ -2.42
GIM3P53900 OST4YDL232W 111 nt-0.06□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.06□□□□□ -2.42
GIM3P53900 PAA1YDR071C 576 nt-0.07□□□□□ -2.42
GIM3P53900 HUG1YML058W-A 207 nt-0.07□□□□□ -2.42
GIM3P53900 RCO1YMR075W 2055 nt-0.08□□□□□ -2.42
GIM3P53900 snR72snR72 98 nt-0.08□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.08□□□□□ -2.42
GIM3P53900 BER1YLR412W 825 nt-0.09□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YOR053WYOR053W 342 nt-0.09□□□□□ -2.42
GIM3P53900 PRP42YDR235W 1635 nt-0.09□□□□□ -2.42
GIM3P53900 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.1□□□□□ -2.43
GIM3P53900 SVS1YPL163C 783 nt-0.1□□□□□ -2.43
GIM3P53900 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.11□□□□□ -2.43
GIM3P53900 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.11□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.11□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.11□□□□□ -2.43
GIM3P53900 RPL35AYDL191W 363 nt-0.12□□□□□ -2.43
GIM3P53900 TIM13YGR181W 318 nt-0.12□□□□□ -2.43
GIM3P53900 RPS20YHL015W 366 nt-0.12□□□□□ -2.43
GIM3P53900 COX5BYIL111W 456 nt-0.12□□□□□ -2.43
GIM3P53900 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
GIM3P53900 EMC4YGL231C 573 nt-0.13□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YBR206WYBR206W 324 nt-0.13□□□□□ -2.43
GIM3P53900 SPO21YOL091W 1830 nt-0.13□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YDL016CYDL016C 303 nt-0.14□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.14□□□□□ -2.43
GIM3P53900 PTP2YOR208W 2253 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 SNU56YDR240C 1479 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YLR232WYLR232W 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 DCP1YOL149W 696 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 GRX5YPL059W 453 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 snR190snR190 190 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 snR51snR51 107 nt-0.15□□□□□ -2.43
GIM3P53900 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.16□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YOL014WYOL014W 375 nt-0.16□□□□□ -2.44
GIM3P53900 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.16□□□□□ -2.44
GIM3P53900 ULI1YFR026C 510 nt-0.17□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YML108WYML108W 318 nt-0.17□□□□□ -2.44
GIM3P53900 NIP100YPL174C 2607 nt-0.17□□□□□ -2.44
GIM3P53900 ORC3YLL004W 1851 nt-0.18□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.18□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.19□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-0.19□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.19□□□□□ -2.44
GIM3P53900 SDH7YDR511W 402 nt-0.2□□□□□ -2.44
GIM3P53900 RPS26AYGL189C 360 nt-0.2□□□□□ -2.44
GIM3P53900 MAM33YIL070C 801 nt-0.2□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YJR011CYJR011C 786 nt-0.2□□□□□ -2.44
GIM3P53900 MRPL50YNR022C 420 nt-0.2□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YCR001WYCR001W 315 nt-0.21□□□□□ -2.44
GIM3P53900 SSS1YDR086C 243 nt-0.21□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.21□□□□□ -2.44
GIM3P53900 MYO1YHR023W 5787 nt-0.21□□□□□ -2.44
GIM3P53900 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-0.22□□□□□ -2.44
GIM3P53900 snR45snR45 172 nt-0.22□□□□□ -2.44
GIM3P53900 THO2YNL139C 4794 nt-0.23□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YOR345CYOR345C 351 nt-0.24□□□□□ -2.45
GIM3P53900 RPF1YHR088W 888 nt-0.25□□□□□ -2.45
GIM3P53900 NFU1YKL040C 771 nt-0.25□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YMR321CYMR321C 318 nt-0.25□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YNL146WYNL146W 303 nt-0.26□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YNL211CYNL211C 261 nt-0.26□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YDL011CYDL011C 324 nt-0.27□□□□□ -2.45
GIM3P53900 ATG31YDR022C 591 nt-0.27□□□□□ -2.45
GIM3P53900 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.27□□□□□ -2.45
GIM3P53900 NNF2YGR089W 2811 nt-0.28□□□□□ -2.45
GIM3P53900 SOV1YMR066W 2697 nt-0.29□□□□□ -2.46
GIM3P53900 LEE1YPL054W 906 nt-0.29□□□□□ -2.46
GIM3P53900 YLR171WYLR171W 390 nt-0.3□□□□□ -2.46
GIM3P53900 YNL058CYNL058C 951 nt-0.3□□□□□ -2.46
GIM3P53900 Q0255Q0255 1419 nt-0.3□□□□□ -2.46
GIM3P53900 NIP1YMR309C 2439 nt-0.3□□□□□ -2.46
GIM3P53900 YPL229WYPL229W 621 nt-0.34□□□□□ -2.46
GIM3P53900 YKU70YMR284W 1809 nt-0.35□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YDR210WYDR210W 228 nt-0.35□□□□□ -2.47
GIM3P53900 QCR9YGR183C 201 nt-0.35□□□□□ -2.47
GIM3P53900 BUL2YML111W 2763 nt-0.36□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-0.36□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YBL071CYBL071C 309 nt-0.36□□□□□ -2.47
GIM3P53900 COY1YKL179C 2040 nt-0.37□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YKL136WYKL136W 399 nt-0.37□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YLR269CYLR269C 351 nt-0.39□□□□□ -2.47
GIM3P53900 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.4□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YHL041WYHL041W 450 nt-0.4□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YAR053WYAR053W 297 nt-0.4□□□□□ -2.47
GIM3P53900 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.41□□□□□ -2.48
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