Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

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Length 1,758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 RPL38YLR325C 237 nt0.52□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.52□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YJL135WYJL135W 318 nt0.52□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 NPC2YDL046W 522 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YPR153WYPR153W 423 nt0.51□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YGR042WYGR042W 816 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YKL123WYKL123W 381 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YPL261CYPL261C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YDR029WYDR029W 315 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 ALG13YGL047W 609 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YBL071CYBL071C 309 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 ZEO1YOL109W 342 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YPL185WYPL185W 396 nt0.48□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 YHR130CYHR130C 336 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 LOA1YPR139C 903 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 RAD34YDR314C 2079 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 BFR2YDR299W 1605 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 EAF6YJR082C 342 nt0.47□□□□□ -2.33
YJL225CP40889 CUL3YGR003W 2235 nt0.46□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YLR287CYLR287C 1068 nt0.46□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 NIP100YPL174C 2607 nt0.46□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 NOP9YJL010C 2001 nt0.46□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 EMC4YGL231C 573 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 snR54snR54 86 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 NPR2YEL062W 1848 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 PBI2YNL015W 228 nt0.45□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 STE18YJR086W 333 nt0.44□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 snR51snR51 107 nt0.44□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 PMP1YCR024C-A 123 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 HAL9YOL089C 3093 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 BPH1YCR032W 6504 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 RPF1YHR088W 888 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YBR064WYBR064W 429 nt0.42□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 RPS20YHL015W 366 nt0.41□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YIR044CYIR044C 186 nt0.41□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YML108WYML108W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 RPB10YOR210W 213 nt0.41□□□□□ -2.34
YJL225CP40889 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.4□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 GPI15YNL038W 690 nt0.4□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 CHS6YJL099W 2241 nt0.4□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YNL058CYNL058C 951 nt0.39□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 ATG31YDR022C 591 nt0.38□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 RPL26AYLR344W 384 nt0.38□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 MRPL50YNR022C 420 nt0.37□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 MAM33YIL070C 801 nt0.37□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 NNF2YGR089W 2811 nt0.36□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 INP2YMR163C 2118 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YHL041WYHL041W 450 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 FYV7YLR068W 456 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YPL044CYPL044C 549 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YPL229WYPL229W 621 nt0.35□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.34□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 YHR125WYHR125W 306 nt0.34□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 snR45snR45 172 nt0.34□□□□□ -2.35
YJL225CP40889 OLI1Q0130 231 nt0.34□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 PTP2YOR208W 2253 nt0.33□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.33□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.33□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YBR206WYBR206W 324 nt0.33□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 DIE2YGR227W 1578 nt0.33□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YJR011CYJR011C 786 nt0.32□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 SDH7YDR511W 402 nt0.32□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YAP6YDR259C 1152 nt0.31□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YNR025CYNR025C 360 nt0.29□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 URB1YKL014C 5295 nt0.29□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 ASE1YOR058C 2658 nt0.29□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 AIM29YKR074W 468 nt0.29□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 FYV10YIL097W 1551 nt0.28□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 YLR269CYLR269C 351 nt0.28□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 PET111YMR257C 2403 nt0.28□□□□□ -2.36
YJL225CP40889 PAA1YDR071C 576 nt0.27□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 RPS24BYIL069C 408 nt0.27□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 CDC33YOL139C 642 nt0.27□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YLR101CYLR101C 396 nt0.27□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 MYO1YHR023W 5787 nt0.26□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 snR72snR72 98 nt0.26□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 RPL26BYGR034W 384 nt0.26□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 HMRA2YCR096C 360 nt0.25□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YAR053WYAR053W 297 nt0.25□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 BSC3YLR465C 309 nt0.25□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 GLG1YKR058W 1851 nt0.25□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 COX5BYIL111W 456 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YLR456WYLR456W 615 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.24□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 ULI1YFR026C 510 nt0.23□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.23□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.23□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.23□□□□□ -2.37
YJL225CP40889 BI2Q0110 1272 nt0.22□□□□□ -2.37
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