Protein–RNA interactions for Protein: P40084

RTR1, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR1P40084 BIG1YHR101C 1008 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR1P40084 RPB10YOR210W 213 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR1P40084 YIR044CYIR044C 186 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR1P40084 RAD34YDR314C 2079 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR1P40084 TIM13YGR181W 318 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YPL185WYPL185W 396 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR1P40084 CUL3YGR003W 2235 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR1P40084 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YCR001WYCR001W 315 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR1P40084 CDC33YOL139C 642 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YFL012WYFL012W 447 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YPL044CYPL044C 549 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR1P40084 YDR344CYDR344C 444 nt0.34□□□□□ -2.36
RTR1P40084 ABF2YMR072W 552 nt0.34□□□□□ -2.36
RTR1P40084 RPS24BYIL069C 408 nt0.33□□□□□ -2.36
RTR1P40084 MLP1YKR095W 5628 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR1P40084 RPL26BYGR034W 384 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR1P40084 NFU1YKL040C 771 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR1P40084 PBI2YNL015W 228 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR1P40084 COG8YML071C 1824 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR1P40084 PRP39YML046W 1890 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR1P40084 BSC3YLR465C 309 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR1P40084 BEM3YPL115C 3387 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR1P40084 TAH1YCR060W 336 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR1P40084 snR72snR72 98 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR1P40084 snR51snR51 107 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR1P40084 MLP2YIL149C 5040 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR1P40084 YDL011CYDL011C 324 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR1P40084 GPI15YNL038W 690 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR1P40084 SEC8YPR055W 3198 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR1P40084 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR1P40084 YKL123WYKL123W 381 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR1P40084 PTP2YOR208W 2253 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 SBH1YER087C-B 249 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YLR269CYLR269C 351 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YNL319WYNL319W 441 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YBR064WYBR064W 429 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 PET111YMR257C 2403 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 FYV10YIL097W 1551 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR1P40084 INP2YMR163C 2118 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YAP6YDR259C 1152 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 OLI1Q0130 231 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YBL071CYBL071C 309 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 ASE1YOR058C 2658 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR1P40084 SDH7YDR511W 402 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR1P40084 EMC4YGL231C 573 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR1P40084 snR78snR78 87 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR1P40084 PAA1YDR071C 576 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR1P40084 RPS20YHL015W 366 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR1P40084 RPF1YHR088W 888 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR1P40084 VIK1YPL253C 1944 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR1P40084 EAF6YJR082C 342 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YNL058CYNL058C 951 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YPL229WYPL229W 621 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR1P40084 MCM10YIL150C 1716 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YML108WYML108W 318 nt0.22□□□□□ -2.37
RTR1P40084 YLR287CYLR287C 1068 nt0.21□□□□□ -2.38
RTR1P40084 SPO21YOL091W 1830 nt0.21□□□□□ -2.38
RTR1P40084 MAM33YIL070C 801 nt0.2□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YHR125WYHR125W 306 nt0.19□□□□□ -2.38
RTR1P40084 ZEO1YOL109W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YBR206WYBR206W 324 nt0.19□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YJR011CYJR011C 786 nt0.18□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YJL113WYJL113W 4647 nt0.18□□□□□ -2.38
RTR1P40084 COX5BYIL111W 456 nt0.17□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.17□□□□□ -2.38
RTR1P40084 NIP100YPL174C 2607 nt0.17□□□□□ -2.38
RTR1P40084 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.15□□□□□ -2.39
RTR1P40084 DIE2YGR227W 1578 nt0.15□□□□□ -2.39
RTR1P40084 HAL9YOL089C 3093 nt0.14□□□□□ -2.39
RTR1P40084 ATG31YDR022C 591 nt0.14□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YHL041WYHL041W 450 nt0.14□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YHR130CYHR130C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
RTR1P40084 snR45snR45 172 nt0.14□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.13□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.13□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.13□□□□□ -2.39
RTR1P40084 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
RTR1P40084 OST4YDL232W 111 nt0.11□□□□□ -2.39
RTR1P40084 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.11□□□□□ -2.39
RTR1P40084 PRP5YBR237W 2550 nt0.11□□□□□ -2.39
RTR1P40084 snR54snR54 86 nt0.1□□□□□ -2.39
RTR1P40084 CSE1YGL238W 2883 nt0.1□□□□□ -2.39
RTR1P40084 STE18YJR086W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
RTR1P40084 YKL083WYKL083W 615 nt0.09□□□□□ -2.4
RTR1P40084 AIM29YKR074W 468 nt0.09□□□□□ -2.4
RTR1P40084 PRP42YDR235W 1635 nt0.09□□□□□ -2.4
RTR1P40084 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.08□□□□□ -2.4
RTR1P40084 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.07□□□□□ -2.4
RTR1P40084 RCO1YMR075W 2055 nt0.06□□□□□ -2.4
RTR1P40084 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.06□□□□□ -2.4
RTR1P40084 YNL211CYNL211C 261 nt0.06□□□□□ -2.4
RTR1P40084 COX12YLR038C 252 nt0.05□□□□□ -2.4
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