Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL1A2P08123 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL1A2P08123 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms