Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDB2O43679 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LDB2O43679 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LDB2O43679 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LDB2O43679 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms