Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 MAK10YEL053C 2202 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 APL2YKL135C 2181 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 RPL37BYDR500C 267 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 ECM12YHR021W-A 456 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 SVL3YPL032C 2478 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 NOC3YLR002C 1992 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 MAD1YGL086W 2250 nt2.44□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 SIR3YLR442C 2937 nt2.44□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 MRP10YDL045W-A 288 nt2.44□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 ACM1YPL267W 630 nt2.44□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 UBP1YDL122W 2430 nt2.43□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YDR239CYDR239C 2364 nt2.43□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 PHO91YNR013C 2685 nt2.42□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YPR097WYPR097W 3222 nt2.42□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 SGS1YMR190C 4344 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YEF3YLR249W 3135 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 ELG1YOR144C 2376 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 RPL31AYDL075W 342 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 ULI1YFR026C 510 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YOR170WYOR170W 306 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 MSB1YOR188W 3414 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 MLH3YPL164C 2148 nt2.41□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 VTC1YER072W 390 nt2.4□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 SGM1YJR134C 2124 nt2.4□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 SPF1YEL031W 3648 nt2.4□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 RTT101YJL047C 2529 nt2.39□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 PIG1YLR273C 1947 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 PAU3YCR104W 375 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 COF1YLL050C 432 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 snR52snR52 92 nt2.38□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 FKS3YMR306W 5358 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 PET309YLR067C 2898 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 AGC1YPR021C 2709 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YIR044CYIR044C 186 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 CTR9YOL145C 3234 nt2.37□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YOR345CYOR345C 351 nt2.36□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 VPS13YLL040C 9435 nt2.36□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 HIR3YJR140C 4947 nt2.36□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 DNA2YHR164C 4569 nt2.35□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 DGR2YKL121W 2559 nt2.35□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YFR016CYFR016C 3702 nt2.34□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 HSL1YKL101W 4557 nt2.34□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YNL170WYNL170W 396 nt2.34□□□□□ -2.03
TMA46Q12000 YLL007CYLL007C 1998 nt2.34□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 NEW1YPL226W 3591 nt2.34□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 LRE1YCL051W 1752 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 HMI1YOL095C 2121 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 IST2YBR086C 2841 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 DNF1YER166W 4716 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 NAB6YML117W 3405 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 SSD1YDR293C 3753 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YER138CYER138C 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YER160CYER160C 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YJR027WYJR027W 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YML039WYML039W 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YML045WYML045W 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YMR050CYMR050C 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.33□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 SCD5YOR329C 2619 nt2.32□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 CUL3YGR003W 2235 nt2.32□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDL196WYDL196W 330 nt2.31□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 PTP2YOR208W 2253 nt2.31□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 KOG1YHR186C 4674 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 IRE1YHR079C 3348 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 BUD2YKL092C 3315 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDL118WYDL118W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 RPL33BYOR234C 324 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 AHC1YOR023C 1701 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 APL5YPL195W 2799 nt2.3□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 USO1YDL058W 5373 nt2.29□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 SKP2YNL311C 2292 nt2.29□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YNL144CYNL144C 2223 nt2.29□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 TFC3YAL001C 3483 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 PDR11YIL013C 4236 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YOL098CYOL098C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 PMP1YCR024C-A 123 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YDR521WYDR521W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 SAP185YJL098W 3177 nt2.28□□□□□ -2.04
TMA46Q12000 ALK1YGL021W 2283 nt2.28□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms