Protein–RNA interactions for Protein: Q04301

VBA1, Vacuolar basic amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA1Q04301 CDC39YCR093W 6327 nt0.91□□□□□ -2.26
VBA1Q04301 SLI15YBR156C 2097 nt0.9□□□□□ -2.26
VBA1Q04301 STO1YMR125W 2586 nt0.9□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.9□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 ZIP2YGL249W 2115 nt0.9□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YKL202WYKL202W 582 nt0.9□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 PDE2YOR360C 1581 nt0.9□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YDL011CYDL011C 324 nt0.89□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.89□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.89□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 RIM20YOR275C 1986 nt0.88□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 DIE2YGR227W 1578 nt0.88□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 ALY2YJL084C 3141 nt0.88□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YML003WYML003W 873 nt0.88□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 RPB10YOR210W 213 nt0.88□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YGR130CYGR130C 2451 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YDL206WYDL206W 2289 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 SCC2YDR180W 4482 nt0.87□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 AIM9YER080W 1884 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 WIP1YDR374W-A 270 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 ERP4YOR016C 624 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 IRC23YOR044W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YOR199WYOR199W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 SLD3YGL113W 2007 nt0.86□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 NUP157YER105C 4176 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 RTT102YGR275W 474 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YJR003CYJR003C 1560 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 KAP120YPL125W 3099 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 LOA1YPR139C 903 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 snR41snR41 95 nt0.85□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 COG4YPR105C 2586 nt0.84□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.84□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YLR101CYLR101C 396 nt0.84□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.84□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.84□□□□□ -2.27
VBA1Q04301 YPR117WYPR117W 7470 nt0.84□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 TOM22YNL131W 459 nt0.83□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YPL229WYPL229W 621 nt0.83□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 ROM2YLR371W 4071 nt0.83□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 WAR1YML076C 2835 nt0.82□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YJL135WYJL135W 318 nt0.82□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 HCH1YNL281W 462 nt0.82□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 TTI1YKL033W 3117 nt0.82□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 SMC1YFL008W 3678 nt0.82□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 CBS1YDL069C 690 nt0.81□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 GPG1YGL121C 381 nt0.81□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 ANS1YHR126C 480 nt0.81□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YOL160WYOL160W 342 nt0.8□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 snR51snR51 107 nt0.8□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 PKH2YOL100W 3246 nt0.79□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YKL083WYKL083W 615 nt0.79□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YPL261CYPL261C 309 nt0.79□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YAR009CYAR009C 3591 nt0.78□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 DOP1YDR141C 5097 nt0.78□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 snR72snR72 98 nt0.78□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 YAR047CYAR047C 321 nt0.78□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 PAU24YBR301W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
VBA1Q04301 PAN2YGL094C 3348 nt0.77□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 SDH7YDR511W 402 nt0.77□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YNL058CYNL058C 951 nt0.77□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 ATP19YOL077W-A 207 nt0.77□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 IFH1YLR223C 3258 nt0.77□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 UBP3YER151C 2739 nt0.76□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YDL196WYDL196W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YHL041WYHL041W 450 nt0.76□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 RAD34YDR314C 2079 nt0.76□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YGR042WYGR042W 816 nt0.75□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.75□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 INP2YMR163C 2118 nt0.75□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 PCF11YDR228C 1881 nt0.75□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YIR044CYIR044C 186 nt0.74□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 UBC7YMR022W 498 nt0.74□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 MRPL50YNR022C 420 nt0.74□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 IES4YOR189W 351 nt0.74□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 GEA2YEL022W 4380 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 DBP6YNR038W 1890 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 CUL3YGR003W 2235 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 YAP6YDR259C 1152 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 ALG13YGL047W 609 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 RPL26AYLR344W 384 nt0.73□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 ISD11YER048W-A 285 nt0.72□□□□□ -2.29
VBA1Q04301 ISF1YMR081C 1017 nt0.71□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 PAC1YOR269W 1485 nt0.7□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 SWF1YDR126W 1011 nt0.7□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 YHL042WYHL042W 453 nt0.7□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 RPS24BYIL069C 408 nt0.7□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 SEC1YDR164C 2175 nt0.69□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 YOR282WYOR282W 321 nt0.68□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 ATG31YDR022C 591 nt0.67□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 MAM33YIL070C 801 nt0.67□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.67□□□□□ -2.3
VBA1Q04301 PTP2YOR208W 2253 nt0.67□□□□□ -2.3
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