Protein–RNA interactions for Protein: Q03697

YMD8, Putative nucleotide-sugar transporter YMD8, yeastyeast

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMD8Q03697 YDL206WYDL206W 2289 nt0.69□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 MMS4YBR098W 2076 nt0.68□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 AIM44YPL158C 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 NPC2YDL046W 522 nt0.67□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 SWF1YDR126W 1011 nt0.67□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.67□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.67□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 RKR1YMR247C 4689 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YGR042WYGR042W 816 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 RPF1YHR088W 888 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 PBI2YNL015W 228 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YNR025CYNR025C 360 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YPL182CYPL182C 384 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 SLI15YBR156C 2097 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 YJR003CYJR003C 1560 nt0.66□□□□□ -2.3
YMD8Q03697 WIP1YDR374W-A 270 nt0.65□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 EMC4YGL231C 573 nt0.65□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 PAN2YGL094C 3348 nt0.64□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.64□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 EAF6YJR082C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 CMC4YMR194C-B 222 nt0.64□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 COG4YPR105C 2586 nt0.64□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YAR009CYAR009C 3591 nt0.63□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 ZIP2YGL249W 2115 nt0.62□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YHL042WYHL042W 453 nt0.62□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YJL135WYJL135W 318 nt0.62□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 LOA1YPR139C 903 nt0.62□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 RIM20YOR275C 1986 nt0.61□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YML108WYML108W 318 nt0.61□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 EFR3YMR212C 2349 nt0.61□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 WAR1YML076C 2835 nt0.6□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 TIM13YGR181W 318 nt0.6□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 PAM16YJL104W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YKL202WYKL202W 582 nt0.6□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 CDC33YOL139C 642 nt0.6□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 ALG13YGL047W 609 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 AIM29YKR074W 468 nt0.59□□□□□ -2.31
YMD8Q03697 YDL011CYDL011C 324 nt0.58□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YHR125WYHR125W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YOL160WYOL160W 342 nt0.58□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.58□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.58□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 PAC1YOR269W 1485 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 RPS27AYKL156W 249 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YBL071CYBL071C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 ZEO1YOL109W 342 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YPL261CYPL261C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 LTE1YAL024C 4308 nt0.57□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 BFR2YDR299W 1605 nt0.56□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 snR72snR72 98 nt0.56□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 ISD11YER048W-A 285 nt0.56□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 UBP3YER151C 2739 nt0.56□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 RAD34YDR314C 2079 nt0.55□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 DBP6YNR038W 1890 nt0.55□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 GPG1YGL121C 381 nt0.55□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.55□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.55□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 BI2Q0110 1272 nt0.53□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 YHR130CYHR130C 336 nt0.53□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 UBC7YMR022W 498 nt0.53□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 RPB10YOR210W 213 nt0.53□□□□□ -2.32
YMD8Q03697 NOP9YJL010C 2001 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 PMP1YCR024C-A 123 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YNL122CYNL122C 348 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 IES4YOR189W 351 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 snR51snR51 107 nt0.52□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YDL158CYDL158C 309 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YLR287CYLR287C 1068 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 PKH2YOL100W 3246 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 GEA2YEL022W 4380 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YSP1YHR155W 3687 nt0.51□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 NIP100YPL174C 2607 nt0.5□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 SDH7YDR511W 402 nt0.5□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YCK3YER123W 1575 nt0.49□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 DIE2YGR227W 1578 nt0.49□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 FYV7YLR068W 456 nt0.49□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YBR064WYBR064W 429 nt0.49□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 CHS6YJL099W 2241 nt0.49□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 YGR290WYGR290W 444 nt0.48□□□□□ -2.33
YMD8Q03697 ECM12YHR021W-A 456 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.7 ms