Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 YPR172WYPR172W 603 nt-1.32□□□□□ -2.62
SSK2P53599 SST2YLR452C 2097 nt-1.32□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.33□□□□□ -2.62
SSK2P53599 RRT1YBL048W 312 nt-1.33□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YGL204CYGL204C 306 nt-1.34□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YKL111CYKL111C 336 nt-1.34□□□□□ -2.62
SSK2P53599 IPP1YBR011C 864 nt-1.34□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-1.34□□□□□ -2.62
SSK2P53599 PEX15YOL044W 1152 nt-1.34□□□□□ -2.62
SSK2P53599 RPL42AYNL162W 321 nt-1.35□□□□□ -2.63
SSK2P53599 ZIP1YDR285W 2628 nt-1.36□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YPL044CYPL044C 549 nt-1.36□□□□□ -2.63
SSK2P53599 MRPL25YGR076C 474 nt-1.37□□□□□ -2.63
SSK2P53599 PRP21YJL203W 843 nt-1.37□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YNR021WYNR021W 1215 nt-1.37□□□□□ -2.63
SSK2P53599 CRG1YHR209W 876 nt-1.38□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YOL118CYOL118C 309 nt-1.38□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-1.38□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.38□□□□□ -2.63
SSK2P53599 RTC6YPL183W-A 282 nt-1.41□□□□□ -2.63
SSK2P53599 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-1.41□□□□□ -2.63
SSK2P53599 ATC1YDR184C 885 nt-1.42□□□□□ -2.64
SSK2P53599 RPL42BYHR141C 321 nt-1.42□□□□□ -2.64
SSK2P53599 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.42□□□□□ -2.64
SSK2P53599 YFL063WYFL063W 456 nt-1.43□□□□□ -2.64
SSK2P53599 YHR054CYHR054C 1065 nt-1.43□□□□□ -2.64
SSK2P53599 MRPL24YMR193W 777 nt-1.45□□□□□ -2.64
SSK2P53599 YFR057WYFR057W 456 nt-1.46□□□□□ -2.64
SSK2P53599 GPG1YGL121C 381 nt-1.46□□□□□ -2.64
SSK2P53599 YOR248WYOR248W 303 nt-1.46□□□□□ -2.64
SSK2P53599 snR44snR44 211 nt-1.46□□□□□ -2.64
SSK2P53599 AI4Q0065 1671 nt-1.47□□□□□ -2.65
SSK2P53599 IRC2YDR112W 309 nt-1.47□□□□□ -2.65
SSK2P53599 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.47□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YJR079WYJR079W 330 nt-1.47□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YBR184WYBR184W 1572 nt-1.47□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.49□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.49□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-1.49□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YPL185WYPL185W 396 nt-1.49□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YDL009CYDL009C 324 nt-1.5□□□□□ -2.65
SSK2P53599 POL32YJR043C 1053 nt-1.5□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.5□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-1.5□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 IST3YIR005W 447 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 BLS1YLR408C 369 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 AEP1YMR064W 1557 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 SPO21YOL091W 1830 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 VAB2YEL005C 849 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSK2P53599 BI3Q0115 1554 nt-1.53□□□□□ -2.65
SSK2P53599 PCL2YDL127W 927 nt-1.53□□□□□ -2.65
SSK2P53599 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.53□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YNL319WYNL319W 441 nt-1.53□□□□□ -2.65
SSK2P53599 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-1.54□□□□□ -2.66
SSK2P53599 BI4Q0120 1917 nt-1.54□□□□□ -2.66
SSK2P53599 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-1.55□□□□□ -2.66
SSK2P53599 PFS1YHR185C 714 nt-1.56□□□□□ -2.66
SSK2P53599 CMC1YKL137W 336 nt-1.57□□□□□ -2.66
SSK2P53599 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.57□□□□□ -2.66
SSK2P53599 YDL068WYDL068W 330 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 RTR2YDR066C 591 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 GIC2YDR309C 1152 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 ECL1YGR146C 636 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 PHO80YOL001W 882 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 YHR138CYHR138C 345 nt-1.59□□□□□ -2.66
SSK2P53599 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-1.6□□□□□ -2.67
SSK2P53599 APQ13YJL075C 417 nt-1.61□□□□□ -2.67
SSK2P53599 SKI7YOR076C 2244 nt-1.62□□□□□ -2.67
SSK2P53599 YER079WYER079W 633 nt-1.63□□□□□ -2.67
SSK2P53599 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.63□□□□□ -2.67
SSK2P53599 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt-1.63□□□□□ -2.67
SSK2P53599 RFA3YJL173C 369 nt-1.63□□□□□ -2.67
SSK2P53599 COX8YLR395C 237 nt-1.64□□□□□ -2.67
SSK2P53599 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-1.64□□□□□ -2.67
SSK2P53599 UBS1YBR165W 834 nt-1.64□□□□□ -2.67
SSK2P53599 SUS1YBR111W-A 291 nt-1.65□□□□□ -2.67
SSK2P53599 SNU56YDR240C 1479 nt-1.66□□□□□ -2.67
SSK2P53599 YIL032CYIL032C 357 nt-1.67□□□□□ -2.68
SSK2P53599 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.67□□□□□ -2.68
SSK2P53599 BET4YJL031C 984 nt-1.67□□□□□ -2.68
SSK2P53599 YIM2YMR151W 438 nt-1.67□□□□□ -2.68
SSK2P53599 ATG31YDR022C 591 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 PAA1YDR071C 576 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 YBR064WYBR064W 429 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 QCR7YDR529C 384 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 TDA2YER071C 381 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 MFA2YNL145W 117 nt-1.68□□□□□ -2.68
SSK2P53599 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-1.69□□□□□ -2.68
SSK2P53599 GPX1YKL026C 504 nt-1.7□□□□□ -2.68
SSK2P53599 ARV1YLR242C 966 nt-1.71□□□□□ -2.68
SSK2P53599 ATX1YNL259C 222 nt-1.72□□□□□ -2.68
SSK2P53599 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.72□□□□□ -2.69
SSK2P53599 RPF1YHR088W 888 nt-1.73□□□□□ -2.69
SSK2P53599 YLR041WYLR041W 321 nt-1.73□□□□□ -2.69
SSK2P53599 ATP15YPL271W 189 nt-1.73□□□□□ -2.69
SSK2P53599 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.74□□□□□ -2.69
SSK2P53599 RSM23YGL129C 1353 nt-1.75□□□□□ -2.69
SSK2P53599 YLL032CYLL032C 2478 nt-1.75□□□□□ -2.69
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