Protein–RNA interactions for Protein: P53094

MDS3, Negative regulator of sporulation MDS3, yeastyeast

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Length 1,487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3P53094 YBR206WYBR206W 324 nt-0.48□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.49□□□□□ -2.49
MDS3P53094 TDA2YER071C 381 nt-0.49□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.49□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.49□□□□□ -2.49
MDS3P53094 ASE1YOR058C 2658 nt-0.49□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YDR008CYDR008C 351 nt-0.5□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YBR071WYBR071W 636 nt-0.5□□□□□ -2.49
MDS3P53094 RAD61YDR014W 1944 nt-0.51□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YDL187CYDL187C 330 nt-0.51□□□□□ -2.49
MDS3P53094 BSC3YLR465C 309 nt-0.51□□□□□ -2.49
MDS3P53094 GSP1YLR293C 660 nt-0.52□□□□□ -2.49
MDS3P53094 MMS21YEL019C 804 nt-0.53□□□□□ -2.49
MDS3P53094 SOV1YMR066W 2697 nt-0.53□□□□□ -2.49
MDS3P53094 YDR029WYDR029W 315 nt-0.54□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YCL002CYCL002C 792 nt-0.54□□□□□ -2.5
MDS3P53094 EFR3YMR212C 2349 nt-0.55□□□□□ -2.5
MDS3P53094 GPG1YGL121C 381 nt-0.55□□□□□ -2.5
MDS3P53094 VPS63YLR261C 327 nt-0.55□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.55□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.57□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.57□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YNL150WYNL150W 408 nt-0.57□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YPL185WYPL185W 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
MDS3P53094 ORC3YLL004W 1851 nt-0.58□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.58□□□□□ -2.5
MDS3P53094 HOT13YKL084W 351 nt-0.58□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YPR099CYPR099C 357 nt-0.6□□□□□ -2.5
MDS3P53094 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.6□□□□□ -2.5
MDS3P53094 RPM2YML091C 3609 nt-0.6□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.61□□□□□ -2.51
MDS3P53094 TFB6YOR352W 1032 nt-0.61□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.62□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.62□□□□□ -2.51
MDS3P53094 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.62□□□□□ -2.51
MDS3P53094 snR8snR8 190 nt-0.63□□□□□ -2.51
MDS3P53094 SBH2YER019C-A 267 nt-0.63□□□□□ -2.51
MDS3P53094 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.63□□□□□ -2.51
MDS3P53094 COX5BYIL111W 456 nt-0.63□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YDR344CYDR344C 444 nt-0.64□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YEL073CYEL073C 324 nt-0.64□□□□□ -2.51
MDS3P53094 PAN3YKL025C 2040 nt-0.64□□□□□ -2.51
MDS3P53094 CUL3YGR003W 2235 nt-0.64□□□□□ -2.51
MDS3P53094 OST4YDL232W 111 nt-0.65□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YFR057WYFR057W 456 nt-0.65□□□□□ -2.51
MDS3P53094 RPS26AYGL189C 360 nt-0.65□□□□□ -2.51
MDS3P53094 TIM13YGR181W 318 nt-0.65□□□□□ -2.51
MDS3P53094 snR79snR79 84 nt-0.66□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.66□□□□□ -2.51
MDS3P53094 MRPL31YKL138C 396 nt-0.66□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YNL211CYNL211C 261 nt-0.66□□□□□ -2.51
MDS3P53094 YPL044CYPL044C 549 nt-0.67□□□□□ -2.52
MDS3P53094 DAD1YDR016C 285 nt-0.67□□□□□ -2.52
MDS3P53094 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.68□□□□□ -2.52
MDS3P53094 IRC2YDR112W 309 nt-0.68□□□□□ -2.52
MDS3P53094 DFG10YIL049W 762 nt-0.68□□□□□ -2.52
MDS3P53094 YJR011CYJR011C 786 nt-0.68□□□□□ -2.52
MDS3P53094 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.68□□□□□ -2.52
MDS3P53094 MCM10YIL150C 1716 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 PRP21YJL203W 843 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 NFU1YKL040C 771 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 YLR271WYLR271W 825 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 CDC33YOL139C 642 nt-0.69□□□□□ -2.52
MDS3P53094 snR59snR59 78 nt-0.71□□□□□ -2.52
MDS3P53094 QCR7YDR529C 384 nt-0.71□□□□□ -2.52
MDS3P53094 LEE1YPL054W 906 nt-0.71□□□□□ -2.52
MDS3P53094 RFX1YLR176C 2436 nt-0.71□□□□□ -2.52
MDS3P53094 BLS1YLR408C 369 nt-0.72□□□□□ -2.52
MDS3P53094 YCR022CYCR022C 345 nt-0.73□□□□□ -2.53
MDS3P53094 AFB1YLR040C 675 nt-0.73□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.73□□□□□ -2.53
MDS3P53094 RUB1YDR139C 234 nt-0.73□□□□□ -2.53
MDS3P53094 ATC1YDR184C 885 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YJR079WYJR079W 330 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 BI4Q0120 1917 nt-0.74□□□□□ -2.53
MDS3P53094 OLI1Q0130 231 nt-0.75□□□□□ -2.53
MDS3P53094 GIM5YML094W 492 nt-0.75□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.75□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YOR366WYOR366W 354 nt-0.75□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.76□□□□□ -2.53
MDS3P53094 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.76□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YLR101CYLR101C 396 nt-0.76□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.76□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YKU70YMR284W 1809 nt-0.77□□□□□ -2.53
MDS3P53094 MAM33YIL070C 801 nt-0.77□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.77□□□□□ -2.53
MDS3P53094 COG6YNL041C 2520 nt-0.77□□□□□ -2.53
MDS3P53094 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
MDS3P53094 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
MDS3P53094 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
MDS3P53094 PSF2YJL072C 642 nt-0.78□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YBR064WYBR064W 429 nt-0.78□□□□□ -2.53
MDS3P53094 YNL146WYNL146W 303 nt-0.79□□□□□ -2.54
MDS3P53094 ECM9YKR004C 1134 nt-0.8□□□□□ -2.54
MDS3P53094 YOL106WYOL106W 354 nt-0.8□□□□□ -2.54
MDS3P53094 NIP1YMR309C 2439 nt-0.8□□□□□ -2.54
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