Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE12Q6L8Q7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms