Protein–RNA interactions for Protein: P25386

USO1, Intracellular protein transport protein USO1, yeast

Predictions only

Length 1,790 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
USO1	P25386	ISA2	YPR067W	558 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
USO1	P25386	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
USO1	P25386	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YPL197C	YPL197C	414 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	CLG1	YGL215W	1359 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	snR84	snR84	550 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	BFR2	YDR299W	1605 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	DSE1	YER124C	1722 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	VMA21	YGR105W	234 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YPR014C	YPR014C	330 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	DXO1	YDR370C	1329 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	CDC10	YCR002C	969 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	COG7	YGL005C	840 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	NME1	NME1	340 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YOR394C-A	YOR394C-A	168 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YBR224W	YBR224W	516 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	HYM1	YKL189W	1200 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
USO1	P25386	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	SLD5	YDR489W	885 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	YOR169C	YOR169C	465 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	YGL138C	YGL138C	1038 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	snR8	snR8	190 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	BFR1	YOR198C	1413 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	ECM11	YDR446W	909 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	STO1	YMR125W	2586 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
USO1	P25386	YHR212C	YHR212C	336 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YAR060C	YAR060C	336 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YCR043C	YCR043C	384 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YPD1	YDL235C	504 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	RRG1	YDR065W	1098 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	RPC25	YKL144C	639 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	IZH4	YOL101C	939 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YBR221W-A	YBR221W-A	105 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	ERV15	YBR210W	429 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	OCA6	YDR067C	675 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	TAN1	YGL232W	870 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	RFX1	YLR176C	2436 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	PDE2	YOR360C	1581 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	AME1	YBR211C	975 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	SPO77	YLR341W	1434 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	YHR145C	YHR145C	357 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
USO1	P25386	HOT13	YKL084W	351 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	YOR105W	YOR105W	327 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	RPS10A	YOR293W	318 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	RRT16	YNL105W	429 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	MIX23	YBL107C	591 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	UPF3	YGR072W	1164 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	YGR114C	YGR114C	390 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	ECM25	YJL201W	1800 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	SCW11	YGL028C	1629 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	BET5	YML077W	480 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	DDR48	YMR173W	1293 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	TMA20	YER007C-A	546 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	REF2	YDR195W	1602 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	DPB11	YJL090C	2295 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	SPO74	YGL170C	1242 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
USO1	P25386	NOC3	YLR002C	1992 nt		-0.97	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YCL020W	YCL020W	1317 nt		-0.97	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	CGI121	YML036W	546 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YNL150W	YNL150W	408 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	NOP12	YOL041C	1380 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YBL029W	YBL029W	1131 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		-1	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		-1	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		-1	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YAL064W	YAL064W	285 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	PMP1	YCR024C-A	123 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	FIG1	YBR040W	897 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	TCA17	YEL048C	459 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	TAP42	YMR028W	1101 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	RPS7B	YNL096C	573 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	snR33	snR33	183 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
USO1	P25386	PFK27	YOL136C	1194 nt		-1.03	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	snR35	snR35	204 nt		-1.03	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	SPR2	YOR214C	711 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	PHO92	YDR374C	921 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	RUF22	RUF22	515 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	VPS28	YPL065W	729 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
USO1	P25386	YCR022C	YCR022C	345 nt		-1.06	□□□□□ -2.58

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