Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TK1P04183 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TK1P04183 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TK1P04183 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TK1P04183 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TK1P04183 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TK1P04183 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TK1P04183 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TK1P04183 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms