Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4933424G06RikA0A140LIP3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms