Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YNR021WYNR021W 1215 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 HHT1YBR010W 411 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 MUD2YKL074C 1584 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 URB1YKL014C 5295 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 AI4Q0065 1671 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 ESP1YGR098C 4893 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YGL217CYGL217C 342 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 DLT1YMR126C 1029 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 BRX1YOL077C 876 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YOL150CYOL150C 312 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YBR224WYBR224W 516 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 BPH1YCR032W 6504 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YGL109WYGL109W 324 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 YGR045CYGR045C 363 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1B-BLQ12490 SGO1YOR073W 1773 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 MZM1YDR493W 372 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 MMS2YGL087C 414 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YIR020CYIR020C 303 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 VPS28YPL065W 729 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 NGG1YDR176W 2109 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SLD5YDR489W 885 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RSM28YDR494W 1086 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YLL020CYLL020C 306 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 OSH6YKR003W 1347 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SLS1YLR139C 1932 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YCR043CYCR043C 384 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 VMA7YGR020C 357 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YAR053WYAR053W 297 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 GRX8YLR364W 330 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RIM20YOR275C 1986 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 NUR1YDL089W 1455 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 IES4YOR189W 351 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 NTC20YBR188C 423 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 snR63snR63 255 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RTR1YER139C 681 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SAY1YGR263C 1275 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RPL9BYNL067W 576 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SLY1YDR189W 2001 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YJL114WYJL114W 681 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RPC25YKL144C 639 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SUT2YPR009W 807 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 MXR1YER042W 555 nt0.23□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 GPX2YBR244W 489 nt0.23□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 MAM1YER106W 909 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RCN1YKL159C 636 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YLR031WYLR031W 561 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 CGI121YML036W 546 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 PGA1YNL158W 597 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YDL196WYDL196W 330 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 IZH4YOL101C 939 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 YPR142CYPR142C 564 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 RRP15YPR143W 753 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BLQ12490 SPT21YMR179W 2277 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YAL064WYAL064W 285 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YKE2YLR200W 345 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 snR13snR13 124 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YBR051WYBR051W 351 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 NEJ1YLR265C 1029 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 MRPL50YNR022C 420 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YOR053WYOR053W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YBR012CYBR012C 420 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YDR262WYDR262W 819 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 PEX34YCL056C 435 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 TOF2YKR010C 2316 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 MLP1YKR095W 5628 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YOL024WYOL024W 519 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 SEC5YDR166C 2916 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 NDD1YOR372C 1665 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YCR016WYCR016W 873 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 SWF1YDR126W 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 SPC2YML055W 537 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 ATP18YML081C-A 180 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 DUO1YGL061C 744 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 TAD1YGL243W 1203 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 BMT5YIL096C 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 GMC2YLR445W 567 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 FAR3YMR052W 615 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YPL034WYPL034W 498 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 MPT5YGL178W 2580 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YBP2YGL060W 1926 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YDR509WYDR509W 348 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 NUT2YPR168W 474 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BLQ12490 YDR199WYDR199W 366 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 KEG1YFR042W 603 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 GPI2YPL076W 843 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 PEP3YLR148W 2757 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 CYC7YEL039C 342 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 IST3YIR005W 447 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YJL032WYJL032W 315 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 HYM1YKL189W 1200 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 DDR48YMR173W 1293 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 ULI1YFR026C 510 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 RPS24BYIL069C 408 nt0.14□□□□□ -2.39
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