Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	SMD1	YGR074W	441 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	LAG1	YHL003C	1236 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YBL077W	YBL077W	432 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	CIN2	YPL241C	807 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	NDD1	YOR372C	1665 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	AFR1	YDR085C	1863 nt		0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YLR225C	YLR225C	1224 nt		0	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	RSM28	YDR494W	1086 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YGL109W	YGL109W	324 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	BRX1	YOL077C	876 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	TOF2	YKR010C	2316 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	MIX23	YBL107C	591 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YOR053W	YOR053W	342 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YMR099C	YMR099C	894 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	FMP23	YBR047W	528 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	YPR170C	YPR170C	336 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
SMC4	Q12267	snR68	snR68	136 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YOL150C	YOL150C	312 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	LOA1	YPR139C	903 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	PIG1	YLR273C	1947 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	MFA1	YDR461W	111 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	LTO1	YNL260C	597 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	MDM36	YPR083W	1740 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	RPL9B	YNL067W	576 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	IES4	YOR189W	351 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	NTC20	YBR188C	423 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	MKT1	YNL085W	2493 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	SLM6	YBR266C	453 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	SAG1	YJR004C	1953 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YGL039W	YGL039W	1047 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YJR071W	YJR071W	369 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	HYM1	YKL189W	1200 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	FUS2	YMR232W	2034 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	ATP18	YML081C-A	180 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	MUD2	YKL074C	1584 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	ECM25	YJL201W	1800 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	PCL2	YDL127W	927 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YDR199W	YDR199W	366 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	ALG13	YGL047W	609 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	SLI15	YBR156C	2097 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
SMC4	Q12267	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	RAM2	YKL019W	951 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	COX12	YLR038C	252 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	TMA20	YER007C-A	546 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YAL064W	YAL064W	285 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YLR042C	YLR042C	486 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YBR012C	YBR012C	420 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	IPI3	YNL182C	1668 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	MVB12	YGR206W	306 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YBL094C	YBL094C	333 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YOR108C-A	YOR108C-A	210 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	GPI2	YPL076W	843 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	snR190	snR190	190 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YBR200W-A	YBR200W-A	165 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	snR46	snR46	197 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	SWI5	YDR146C	2130 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	VIK1	YPL253C	1944 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	OSH6	YKR003W	1347 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YCR043C	YCR043C	384 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	RPC25	YKL144C	639 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YNL089C	YNL089C	477 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YOR199W	YOR199W	330 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YBR221W-A	YBR221W-A	105 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	PRP5	YBR237W	2550 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	NUR1	YDL089W	1455 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	COG7	YGL005C	840 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	IMP3	YHR148W	552 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YLR031W	YLR031W	561 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	RAD10	YML095C	633 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YPR153W	YPR153W	423 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YJL049W	YJL049W	1353 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	SLS1	YLR139C	1932 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	SBH1	YER087C-B	249 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YGR045C	YGR045C	363 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	NUT2	YPR168W	474 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	TAP42	YMR028W	1101 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	RRT16	YNL105W	429 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	PEX15	YOL044W	1152 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
SMC4	Q12267	YCR016W	YCR016W	873 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	RPC10	YHR143W-A	213 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	GRX8	YLR364W	330 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	DDR48	YMR173W	1293 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	RCN2	YOR220W	798 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	DPB11	YJL090C	2295 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	YBP2	YGL060W	1926 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
SMC4	Q12267	YPD1	YDL235C	504 nt		-0.17	□□□□□ -2.44

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