Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga1P29974 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms