Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbip1J3QMK2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms