Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Psmb10O35955 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb10O35955 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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