Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E1P29083 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E1P29083 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms