Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx6Q9R1R0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx6Q9R1R0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx6Q9R1R0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx6Q9R1R0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx6Q9R1R0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx6Q9R1R0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms