Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ercc6l2Q9JIM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ercc6l2Q9JIM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ercc6l2Q9JIM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Ercc6l2Q9JIM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ercc6l2Q9JIM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms