Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce1Q9D720 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nsmce1Q9D720 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nsmce1Q9D720 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nsmce1Q9D720 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nsmce1Q9D720 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsmce1Q9D720 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms