Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Nrxn1Q9CS84 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Nrxn1Q9CS84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nrxn1Q9CS84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nrxn1Q9CS84 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nrxn1Q9CS84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nrxn1Q9CS84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nrxn1Q9CS84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nrxn1Q9CS84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nrxn1Q9CS84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nrxn1Q9CS84 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nrxn1Q9CS84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nrxn1Q9CS84 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nrxn1Q9CS84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Nrxn1Q9CS84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nrxn1Q9CS84 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms