Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b1Q99NB9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sf3b1Q99NB9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b1Q99NB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b1Q99NB9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sf3b1Q99NB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b1Q99NB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b1Q99NB9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms