Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atoh8Q99NA2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh8Q99NA2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atoh8Q99NA2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atoh8Q99NA2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh8Q99NA2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atoh8Q99NA2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atoh8Q99NA2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms