Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Acsl6Q91WC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acsl6Q91WC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acsl6Q91WC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acsl6Q91WC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl6Q91WC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acsl6Q91WC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Acsl6Q91WC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acsl6Q91WC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms