Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0N9

Zdhhc1, Probable palmitoyltransferase ZDHHC1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc1Q8R0N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zdhhc1Q8R0N9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc1Q8R0N9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc1Q8R0N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zdhhc1Q8R0N9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zdhhc1Q8R0N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zdhhc1Q8R0N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms