Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Aebp1Q640N1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Aebp1Q640N1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Aebp1Q640N1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Aebp1Q640N1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Aebp1Q640N1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Aebp1Q640N1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Aebp1Q640N1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Aebp1Q640N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Aebp1Q640N1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Aebp1Q640N1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Aebp1Q640N1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Aebp1Q640N1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Aebp1Q640N1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Aebp1Q640N1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Aebp1Q640N1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Aebp1Q640N1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Aebp1Q640N1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Aebp1Q640N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Aebp1Q640N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms