Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MslnQ61468 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MslnQ61468 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MslnQ61468 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MslnQ61468 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MslnQ61468 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MslnQ61468 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MslnQ61468 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MslnQ61468 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms