Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
MslnQ61468 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
MslnQ61468 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MslnQ61468 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
MslnQ61468 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
MslnQ61468 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MslnQ61468 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MslnQ61468 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MslnQ61468 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MslnQ61468 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MslnQ61468 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MslnQ61468 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
MslnQ61468 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MslnQ61468 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MslnQ61468 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MslnQ61468 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MslnQ61468 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MslnQ61468 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MslnQ61468 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MslnQ61468 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
MslnQ61468 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MslnQ61468 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MslnQ61468 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MslnQ61468 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MslnQ61468 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MslnQ61468 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MslnQ61468 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MslnQ61468 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MslnQ61468 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MslnQ61468 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MslnQ61468 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MslnQ61468 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
MslnQ61468 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
MslnQ61468 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MslnQ61468 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
MslnQ61468 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MslnQ61468 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MslnQ61468 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MslnQ61468 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MslnQ61468 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MslnQ61468 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MslnQ61468 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MslnQ61468 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MslnQ61468 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MslnQ61468 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MslnQ61468 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MslnQ61468 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MslnQ61468 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MslnQ61468 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MslnQ61468 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MslnQ61468 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MslnQ61468 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MslnQ61468 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MslnQ61468 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MslnQ61468 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MslnQ61468 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MslnQ61468 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MslnQ61468 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MslnQ61468 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MslnQ61468 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MslnQ61468 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
MslnQ61468 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MslnQ61468 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MslnQ61468 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MslnQ61468 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MslnQ61468 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MslnQ61468 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MslnQ61468 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MslnQ61468 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MslnQ61468 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MslnQ61468 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MslnQ61468 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MslnQ61468 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MslnQ61468 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MslnQ61468 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MslnQ61468 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MslnQ61468 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MslnQ61468 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MslnQ61468 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MslnQ61468 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MslnQ61468 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MslnQ61468 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MslnQ61468 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MslnQ61468 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MslnQ61468 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MslnQ61468 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MslnQ61468 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MslnQ61468 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MslnQ61468 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MslnQ61468 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MslnQ61468 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MslnQ61468 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MslnQ61468 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MslnQ61468 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MslnQ61468 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms