Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DroshaQ5HZJ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DroshaQ5HZJ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DroshaQ5HZJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DroshaQ5HZJ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
DroshaQ5HZJ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DroshaQ5HZJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DroshaQ5HZJ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DroshaQ5HZJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DroshaQ5HZJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DroshaQ5HZJ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DroshaQ5HZJ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DroshaQ5HZJ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
DroshaQ5HZJ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
DroshaQ5HZJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
DroshaQ5HZJ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
DroshaQ5HZJ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
DroshaQ5HZJ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
DroshaQ5HZJ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms