Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palb2Q3U0P1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Palb2Q3U0P1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Palb2Q3U0P1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Palb2Q3U0P1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Palb2Q3U0P1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Palb2Q3U0P1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Palb2Q3U0P1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Palb2Q3U0P1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms