Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Shroom4Q1W617 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Shroom4Q1W617 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Shroom4Q1W617 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Shroom4Q1W617 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Shroom4Q1W617 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Shroom4Q1W617 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Shroom4Q1W617 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Shroom4Q1W617 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Shroom4Q1W617 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Shroom4Q1W617 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Shroom4Q1W617 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Shroom4Q1W617 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Shroom4Q1W617 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Shroom4Q1W617 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Shroom4Q1W617 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Shroom4Q1W617 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Shroom4Q1W617 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Shroom4Q1W617 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Shroom4Q1W617 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Shroom4Q1W617 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Shroom4Q1W617 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Shroom4Q1W617 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms