Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp11aP98197 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp11aP98197 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp11aP98197 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp11aP98197 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp11aP98197 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp11aP98197 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp11aP98197 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp11aP98197 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp11aP98197 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp11aP98197 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Atp11aP98197 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atp11aP98197 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.5 ms